Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIG8

SLCO3A1, Solute carrier organic anion transporter family member 3A1, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO3A1Q9UIG8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLCO3A1Q9UIG8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLCO3A1Q9UIG8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLCO3A1Q9UIG8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLCO3A1Q9UIG8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLCO3A1Q9UIG8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLCO3A1Q9UIG8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLCO3A1Q9UIG8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLCO3A1Q9UIG8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLCO3A1Q9UIG8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLCO3A1Q9UIG8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLCO3A1Q9UIG8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLCO3A1Q9UIG8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLCO3A1Q9UIG8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLCO3A1Q9UIG8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLCO3A1Q9UIG8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLCO3A1Q9UIG8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLCO3A1Q9UIG8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLCO3A1Q9UIG8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLCO3A1Q9UIG8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLCO3A1Q9UIG8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLCO3A1Q9UIG8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLCO3A1Q9UIG8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLCO3A1Q9UIG8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLCO3A1Q9UIG8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLCO3A1Q9UIG8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLCO3A1Q9UIG8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLCO3A1Q9UIG8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLCO3A1Q9UIG8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLCO3A1Q9UIG8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLCO3A1Q9UIG8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLCO3A1Q9UIG8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLCO3A1Q9UIG8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLCO3A1Q9UIG8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLCO3A1Q9UIG8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLCO3A1Q9UIG8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLCO3A1Q9UIG8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLCO3A1Q9UIG8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLCO3A1Q9UIG8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLCO3A1Q9UIG8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLCO3A1Q9UIG8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLCO3A1Q9UIG8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLCO3A1Q9UIG8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLCO3A1Q9UIG8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLCO3A1Q9UIG8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLCO3A1Q9UIG8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLCO3A1Q9UIG8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLCO3A1Q9UIG8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLCO3A1Q9UIG8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLCO3A1Q9UIG8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLCO3A1Q9UIG8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLCO3A1Q9UIG8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLCO3A1Q9UIG8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLCO3A1Q9UIG8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLCO3A1Q9UIG8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLCO3A1Q9UIG8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLCO3A1Q9UIG8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLCO3A1Q9UIG8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLCO3A1Q9UIG8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLCO3A1Q9UIG8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLCO3A1Q9UIG8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLCO3A1Q9UIG8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLCO3A1Q9UIG8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLCO3A1Q9UIG8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLCO3A1Q9UIG8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLCO3A1Q9UIG8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLCO3A1Q9UIG8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLCO3A1Q9UIG8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLCO3A1Q9UIG8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLCO3A1Q9UIG8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLCO3A1Q9UIG8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLCO3A1Q9UIG8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLCO3A1Q9UIG8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLCO3A1Q9UIG8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLCO3A1Q9UIG8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLCO3A1Q9UIG8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLCO3A1Q9UIG8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLCO3A1Q9UIG8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLCO3A1Q9UIG8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLCO3A1Q9UIG8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SLCO3A1Q9UIG8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLCO3A1Q9UIG8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLCO3A1Q9UIG8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLCO3A1Q9UIG8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLCO3A1Q9UIG8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLCO3A1Q9UIG8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLCO3A1Q9UIG8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLCO3A1Q9UIG8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLCO3A1Q9UIG8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLCO3A1Q9UIG8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLCO3A1Q9UIG8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLCO3A1Q9UIG8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLCO3A1Q9UIG8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLCO3A1Q9UIG8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLCO3A1Q9UIG8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLCO3A1Q9UIG8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLCO3A1Q9UIG8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLCO3A1Q9UIG8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLCO3A1Q9UIG8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLCO3A1Q9UIG8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms