Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHI6

DDX20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX20Q9UHI6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX20Q9UHI6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX20Q9UHI6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX20Q9UHI6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX20Q9UHI6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX20Q9UHI6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX20Q9UHI6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX20Q9UHI6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX20Q9UHI6 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX20Q9UHI6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX20Q9UHI6 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX20Q9UHI6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX20Q9UHI6 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX20Q9UHI6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX20Q9UHI6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX20Q9UHI6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX20Q9UHI6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX20Q9UHI6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX20Q9UHI6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX20Q9UHI6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX20Q9UHI6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX20Q9UHI6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX20Q9UHI6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX20Q9UHI6 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX20Q9UHI6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX20Q9UHI6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX20Q9UHI6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX20Q9UHI6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX20Q9UHI6 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX20Q9UHI6 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX20Q9UHI6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX20Q9UHI6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX20Q9UHI6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX20Q9UHI6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX20Q9UHI6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX20Q9UHI6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX20Q9UHI6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX20Q9UHI6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX20Q9UHI6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX20Q9UHI6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX20Q9UHI6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX20Q9UHI6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX20Q9UHI6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX20Q9UHI6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX20Q9UHI6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX20Q9UHI6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX20Q9UHI6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX20Q9UHI6 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX20Q9UHI6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX20Q9UHI6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX20Q9UHI6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX20Q9UHI6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX20Q9UHI6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX20Q9UHI6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX20Q9UHI6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX20Q9UHI6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX20Q9UHI6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX20Q9UHI6 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX20Q9UHI6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX20Q9UHI6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX20Q9UHI6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX20Q9UHI6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX20Q9UHI6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX20Q9UHI6 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX20Q9UHI6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX20Q9UHI6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX20Q9UHI6 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX20Q9UHI6 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX20Q9UHI6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX20Q9UHI6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX20Q9UHI6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX20Q9UHI6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX20Q9UHI6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX20Q9UHI6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX20Q9UHI6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX20Q9UHI6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX20Q9UHI6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX20Q9UHI6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX20Q9UHI6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX20Q9UHI6 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX20Q9UHI6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX20Q9UHI6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDX20Q9UHI6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDX20Q9UHI6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDX20Q9UHI6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDX20Q9UHI6 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDX20Q9UHI6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDX20Q9UHI6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DDX20Q9UHI6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DDX20Q9UHI6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
DDX20Q9UHI6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX20Q9UHI6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX20Q9UHI6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX20Q9UHI6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX20Q9UHI6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX20Q9UHI6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX20Q9UHI6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX20Q9UHI6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX20Q9UHI6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX20Q9UHI6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms