Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGC7

MTRF1L, Peptide chain release factor 1-like, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRF1LQ9UGC7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MTRF1LQ9UGC7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MTRF1LQ9UGC7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MTRF1LQ9UGC7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MTRF1LQ9UGC7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MTRF1LQ9UGC7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MTRF1LQ9UGC7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MTRF1LQ9UGC7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MTRF1LQ9UGC7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MTRF1LQ9UGC7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTRF1LQ9UGC7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTRF1LQ9UGC7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTRF1LQ9UGC7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MTRF1LQ9UGC7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTRF1LQ9UGC7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTRF1LQ9UGC7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTRF1LQ9UGC7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTRF1LQ9UGC7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTRF1LQ9UGC7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTRF1LQ9UGC7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTRF1LQ9UGC7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTRF1LQ9UGC7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTRF1LQ9UGC7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTRF1LQ9UGC7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTRF1LQ9UGC7 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTRF1LQ9UGC7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTRF1LQ9UGC7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTRF1LQ9UGC7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTRF1LQ9UGC7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTRF1LQ9UGC7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTRF1LQ9UGC7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTRF1LQ9UGC7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTRF1LQ9UGC7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTRF1LQ9UGC7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTRF1LQ9UGC7 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTRF1LQ9UGC7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTRF1LQ9UGC7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTRF1LQ9UGC7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MTRF1LQ9UGC7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTRF1LQ9UGC7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTRF1LQ9UGC7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTRF1LQ9UGC7 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTRF1LQ9UGC7 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTRF1LQ9UGC7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTRF1LQ9UGC7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTRF1LQ9UGC7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTRF1LQ9UGC7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTRF1LQ9UGC7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTRF1LQ9UGC7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTRF1LQ9UGC7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTRF1LQ9UGC7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTRF1LQ9UGC7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTRF1LQ9UGC7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTRF1LQ9UGC7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTRF1LQ9UGC7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTRF1LQ9UGC7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTRF1LQ9UGC7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTRF1LQ9UGC7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTRF1LQ9UGC7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTRF1LQ9UGC7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTRF1LQ9UGC7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTRF1LQ9UGC7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTRF1LQ9UGC7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTRF1LQ9UGC7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTRF1LQ9UGC7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTRF1LQ9UGC7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTRF1LQ9UGC7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MTRF1LQ9UGC7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTRF1LQ9UGC7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTRF1LQ9UGC7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTRF1LQ9UGC7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTRF1LQ9UGC7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTRF1LQ9UGC7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTRF1LQ9UGC7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTRF1LQ9UGC7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTRF1LQ9UGC7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTRF1LQ9UGC7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTRF1LQ9UGC7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTRF1LQ9UGC7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTRF1LQ9UGC7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MTRF1LQ9UGC7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTRF1LQ9UGC7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTRF1LQ9UGC7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTRF1LQ9UGC7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTRF1LQ9UGC7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MTRF1LQ9UGC7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTRF1LQ9UGC7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MTRF1LQ9UGC7 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MTRF1LQ9UGC7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTRF1LQ9UGC7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTRF1LQ9UGC7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTRF1LQ9UGC7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTRF1LQ9UGC7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MTRF1LQ9UGC7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTRF1LQ9UGC7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTRF1LQ9UGC7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTRF1LQ9UGC7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTRF1LQ9UGC7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTRF1LQ9UGC7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTRF1LQ9UGC7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms