Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL42Q9P2K6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL42Q9P2K6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL42Q9P2K6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL42Q9P2K6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL42Q9P2K6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL42Q9P2K6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL42Q9P2K6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL42Q9P2K6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL42Q9P2K6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL42Q9P2K6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL42Q9P2K6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL42Q9P2K6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL42Q9P2K6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL42Q9P2K6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL42Q9P2K6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL42Q9P2K6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL42Q9P2K6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL42Q9P2K6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL42Q9P2K6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL42Q9P2K6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL42Q9P2K6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL42Q9P2K6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL42Q9P2K6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL42Q9P2K6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL42Q9P2K6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL42Q9P2K6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL42Q9P2K6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL42Q9P2K6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL42Q9P2K6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL42Q9P2K6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL42Q9P2K6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL42Q9P2K6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL42Q9P2K6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL42Q9P2K6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL42Q9P2K6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL42Q9P2K6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL42Q9P2K6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL42Q9P2K6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL42Q9P2K6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL42Q9P2K6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL42Q9P2K6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL42Q9P2K6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL42Q9P2K6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL42Q9P2K6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL42Q9P2K6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL42Q9P2K6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL42Q9P2K6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL42Q9P2K6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL42Q9P2K6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL42Q9P2K6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL42Q9P2K6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL42Q9P2K6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL42Q9P2K6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL42Q9P2K6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL42Q9P2K6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL42Q9P2K6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL42Q9P2K6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL42Q9P2K6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL42Q9P2K6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL42Q9P2K6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL42Q9P2K6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL42Q9P2K6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL42Q9P2K6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL42Q9P2K6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL42Q9P2K6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL42Q9P2K6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL42Q9P2K6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL42Q9P2K6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL42Q9P2K6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL42Q9P2K6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL42Q9P2K6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL42Q9P2K6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL42Q9P2K6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL42Q9P2K6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL42Q9P2K6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL42Q9P2K6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL42Q9P2K6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL42Q9P2K6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL42Q9P2K6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL42Q9P2K6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL42Q9P2K6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL42Q9P2K6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL42Q9P2K6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL42Q9P2K6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL42Q9P2K6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL42Q9P2K6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL42Q9P2K6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL42Q9P2K6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL42Q9P2K6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL42Q9P2K6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL42Q9P2K6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL42Q9P2K6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL42Q9P2K6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL42Q9P2K6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL42Q9P2K6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL42Q9P2K6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL42Q9P2K6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL42Q9P2K6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
KLHL42Q9P2K6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms