Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W0

IFNK, Interferon kappa, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNKQ9P0W0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFNKQ9P0W0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFNKQ9P0W0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFNKQ9P0W0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFNKQ9P0W0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFNKQ9P0W0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFNKQ9P0W0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
IFNKQ9P0W0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFNKQ9P0W0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFNKQ9P0W0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFNKQ9P0W0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFNKQ9P0W0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFNKQ9P0W0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFNKQ9P0W0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFNKQ9P0W0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFNKQ9P0W0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFNKQ9P0W0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFNKQ9P0W0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFNKQ9P0W0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFNKQ9P0W0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFNKQ9P0W0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFNKQ9P0W0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
IFNKQ9P0W0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFNKQ9P0W0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
IFNKQ9P0W0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
IFNKQ9P0W0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFNKQ9P0W0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFNKQ9P0W0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFNKQ9P0W0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFNKQ9P0W0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
IFNKQ9P0W0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFNKQ9P0W0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFNKQ9P0W0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
IFNKQ9P0W0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFNKQ9P0W0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFNKQ9P0W0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFNKQ9P0W0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
IFNKQ9P0W0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFNKQ9P0W0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFNKQ9P0W0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFNKQ9P0W0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFNKQ9P0W0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFNKQ9P0W0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFNKQ9P0W0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFNKQ9P0W0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFNKQ9P0W0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFNKQ9P0W0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFNKQ9P0W0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFNKQ9P0W0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFNKQ9P0W0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
IFNKQ9P0W0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFNKQ9P0W0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFNKQ9P0W0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFNKQ9P0W0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFNKQ9P0W0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFNKQ9P0W0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFNKQ9P0W0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFNKQ9P0W0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
IFNKQ9P0W0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFNKQ9P0W0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFNKQ9P0W0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
IFNKQ9P0W0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFNKQ9P0W0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFNKQ9P0W0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFNKQ9P0W0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFNKQ9P0W0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFNKQ9P0W0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
IFNKQ9P0W0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFNKQ9P0W0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFNKQ9P0W0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFNKQ9P0W0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFNKQ9P0W0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFNKQ9P0W0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFNKQ9P0W0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFNKQ9P0W0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFNKQ9P0W0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFNKQ9P0W0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFNKQ9P0W0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFNKQ9P0W0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFNKQ9P0W0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFNKQ9P0W0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFNKQ9P0W0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFNKQ9P0W0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFNKQ9P0W0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFNKQ9P0W0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFNKQ9P0W0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFNKQ9P0W0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFNKQ9P0W0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFNKQ9P0W0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFNKQ9P0W0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFNKQ9P0W0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFNKQ9P0W0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFNKQ9P0W0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFNKQ9P0W0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFNKQ9P0W0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFNKQ9P0W0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFNKQ9P0W0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFNKQ9P0W0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFNKQ9P0W0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFNKQ9P0W0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms