Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SH3BP4Q9P0V3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SH3BP4Q9P0V3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SH3BP4Q9P0V3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SH3BP4Q9P0V3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SH3BP4Q9P0V3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SH3BP4Q9P0V3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SH3BP4Q9P0V3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SH3BP4Q9P0V3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SH3BP4Q9P0V3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SH3BP4Q9P0V3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SH3BP4Q9P0V3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SH3BP4Q9P0V3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SH3BP4Q9P0V3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SH3BP4Q9P0V3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SH3BP4Q9P0V3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SH3BP4Q9P0V3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SH3BP4Q9P0V3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SH3BP4Q9P0V3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SH3BP4Q9P0V3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SH3BP4Q9P0V3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SH3BP4Q9P0V3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SH3BP4Q9P0V3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SH3BP4Q9P0V3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SH3BP4Q9P0V3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SH3BP4Q9P0V3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SH3BP4Q9P0V3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SH3BP4Q9P0V3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SH3BP4Q9P0V3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
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SH3BP4Q9P0V3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SH3BP4Q9P0V3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SH3BP4Q9P0V3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
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SH3BP4Q9P0V3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SH3BP4Q9P0V3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
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SH3BP4Q9P0V3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
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SH3BP4Q9P0V3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
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SH3BP4Q9P0V3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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SH3BP4Q9P0V3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
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SH3BP4Q9P0V3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SH3BP4Q9P0V3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SH3BP4Q9P0V3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SH3BP4Q9P0V3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SH3BP4Q9P0V3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SH3BP4Q9P0V3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SH3BP4Q9P0V3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SH3BP4Q9P0V3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SH3BP4Q9P0V3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SH3BP4Q9P0V3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SH3BP4Q9P0V3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SH3BP4Q9P0V3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SH3BP4Q9P0V3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SH3BP4Q9P0V3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SH3BP4Q9P0V3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SH3BP4Q9P0V3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SH3BP4Q9P0V3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SH3BP4Q9P0V3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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