Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
KCMF1Q9P0J7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KCMF1Q9P0J7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KCMF1Q9P0J7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KCMF1Q9P0J7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
KCMF1Q9P0J7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KCMF1Q9P0J7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCMF1Q9P0J7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCMF1Q9P0J7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCMF1Q9P0J7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCMF1Q9P0J7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCMF1Q9P0J7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
KCMF1Q9P0J7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCMF1Q9P0J7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCMF1Q9P0J7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCMF1Q9P0J7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCMF1Q9P0J7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCMF1Q9P0J7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCMF1Q9P0J7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCMF1Q9P0J7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCMF1Q9P0J7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCMF1Q9P0J7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCMF1Q9P0J7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCMF1Q9P0J7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCMF1Q9P0J7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCMF1Q9P0J7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCMF1Q9P0J7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCMF1Q9P0J7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCMF1Q9P0J7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCMF1Q9P0J7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCMF1Q9P0J7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCMF1Q9P0J7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
KCMF1Q9P0J7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
KCMF1Q9P0J7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCMF1Q9P0J7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCMF1Q9P0J7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCMF1Q9P0J7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCMF1Q9P0J7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCMF1Q9P0J7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCMF1Q9P0J7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCMF1Q9P0J7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
KCMF1Q9P0J7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCMF1Q9P0J7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCMF1Q9P0J7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCMF1Q9P0J7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCMF1Q9P0J7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCMF1Q9P0J7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCMF1Q9P0J7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCMF1Q9P0J7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
KCMF1Q9P0J7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCMF1Q9P0J7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCMF1Q9P0J7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCMF1Q9P0J7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCMF1Q9P0J7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCMF1Q9P0J7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCMF1Q9P0J7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCMF1Q9P0J7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCMF1Q9P0J7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCMF1Q9P0J7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCMF1Q9P0J7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCMF1Q9P0J7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCMF1Q9P0J7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCMF1Q9P0J7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCMF1Q9P0J7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCMF1Q9P0J7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCMF1Q9P0J7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCMF1Q9P0J7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCMF1Q9P0J7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCMF1Q9P0J7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCMF1Q9P0J7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCMF1Q9P0J7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCMF1Q9P0J7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCMF1Q9P0J7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCMF1Q9P0J7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCMF1Q9P0J7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
KCMF1Q9P0J7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
KCMF1Q9P0J7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCMF1Q9P0J7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
KCMF1Q9P0J7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCMF1Q9P0J7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
KCMF1Q9P0J7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCMF1Q9P0J7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCMF1Q9P0J7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCMF1Q9P0J7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCMF1Q9P0J7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCMF1Q9P0J7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCMF1Q9P0J7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCMF1Q9P0J7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCMF1Q9P0J7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
KCMF1Q9P0J7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms