Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ9

TMOD4, Tropomodulin-4, humanhuman

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Length 345 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD4Q9NZQ9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMOD4Q9NZQ9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TMOD4Q9NZQ9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMOD4Q9NZQ9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMOD4Q9NZQ9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TMOD4Q9NZQ9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMOD4Q9NZQ9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMOD4Q9NZQ9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMOD4Q9NZQ9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMOD4Q9NZQ9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMOD4Q9NZQ9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMOD4Q9NZQ9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMOD4Q9NZQ9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TMOD4Q9NZQ9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMOD4Q9NZQ9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMOD4Q9NZQ9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMOD4Q9NZQ9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMOD4Q9NZQ9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMOD4Q9NZQ9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TMOD4Q9NZQ9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMOD4Q9NZQ9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TMOD4Q9NZQ9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMOD4Q9NZQ9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMOD4Q9NZQ9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMOD4Q9NZQ9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMOD4Q9NZQ9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMOD4Q9NZQ9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMOD4Q9NZQ9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMOD4Q9NZQ9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TMOD4Q9NZQ9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMOD4Q9NZQ9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMOD4Q9NZQ9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMOD4Q9NZQ9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMOD4Q9NZQ9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMOD4Q9NZQ9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMOD4Q9NZQ9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TMOD4Q9NZQ9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TMOD4Q9NZQ9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TMOD4Q9NZQ9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TMOD4Q9NZQ9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMOD4Q9NZQ9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMOD4Q9NZQ9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMOD4Q9NZQ9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMOD4Q9NZQ9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TMOD4Q9NZQ9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TMOD4Q9NZQ9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMOD4Q9NZQ9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMOD4Q9NZQ9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMOD4Q9NZQ9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TMOD4Q9NZQ9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMOD4Q9NZQ9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMOD4Q9NZQ9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMOD4Q9NZQ9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TMOD4Q9NZQ9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMOD4Q9NZQ9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMOD4Q9NZQ9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMOD4Q9NZQ9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMOD4Q9NZQ9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMOD4Q9NZQ9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMOD4Q9NZQ9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMOD4Q9NZQ9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMOD4Q9NZQ9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMOD4Q9NZQ9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TMOD4Q9NZQ9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMOD4Q9NZQ9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMOD4Q9NZQ9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMOD4Q9NZQ9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMOD4Q9NZQ9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMOD4Q9NZQ9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMOD4Q9NZQ9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMOD4Q9NZQ9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMOD4Q9NZQ9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMOD4Q9NZQ9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMOD4Q9NZQ9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMOD4Q9NZQ9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMOD4Q9NZQ9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMOD4Q9NZQ9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TMOD4Q9NZQ9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMOD4Q9NZQ9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMOD4Q9NZQ9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMOD4Q9NZQ9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMOD4Q9NZQ9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMOD4Q9NZQ9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMOD4Q9NZQ9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMOD4Q9NZQ9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMOD4Q9NZQ9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMOD4Q9NZQ9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMOD4Q9NZQ9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMOD4Q9NZQ9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMOD4Q9NZQ9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMOD4Q9NZQ9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMOD4Q9NZQ9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMOD4Q9NZQ9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMOD4Q9NZQ9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMOD4Q9NZQ9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMOD4Q9NZQ9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMOD4Q9NZQ9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TMOD4Q9NZQ9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TMOD4Q9NZQ9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMOD4Q9NZQ9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
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