Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZJ4

SACS, Sacsin, humanhuman

Predictions only

Length 4,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SACSQ9NZJ4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SACSQ9NZJ4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SACSQ9NZJ4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SACSQ9NZJ4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SACSQ9NZJ4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SACSQ9NZJ4 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SACSQ9NZJ4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SACSQ9NZJ4 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SACSQ9NZJ4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SACSQ9NZJ4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SACSQ9NZJ4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SACSQ9NZJ4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SACSQ9NZJ4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SACSQ9NZJ4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SACSQ9NZJ4 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SACSQ9NZJ4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SACSQ9NZJ4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SACSQ9NZJ4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SACSQ9NZJ4 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SACSQ9NZJ4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SACSQ9NZJ4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SACSQ9NZJ4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SACSQ9NZJ4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SACSQ9NZJ4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SACSQ9NZJ4 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SACSQ9NZJ4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SACSQ9NZJ4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SACSQ9NZJ4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SACSQ9NZJ4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SACSQ9NZJ4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SACSQ9NZJ4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SACSQ9NZJ4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SACSQ9NZJ4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SACSQ9NZJ4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SACSQ9NZJ4 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SACSQ9NZJ4 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SACSQ9NZJ4 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SACSQ9NZJ4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SACSQ9NZJ4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SACSQ9NZJ4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SACSQ9NZJ4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SACSQ9NZJ4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SACSQ9NZJ4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SACSQ9NZJ4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SACSQ9NZJ4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SACSQ9NZJ4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SACSQ9NZJ4 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SACSQ9NZJ4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SACSQ9NZJ4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SACSQ9NZJ4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SACSQ9NZJ4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SACSQ9NZJ4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SACSQ9NZJ4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SACSQ9NZJ4 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SACSQ9NZJ4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SACSQ9NZJ4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SACSQ9NZJ4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SACSQ9NZJ4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SACSQ9NZJ4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SACSQ9NZJ4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SACSQ9NZJ4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SACSQ9NZJ4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SACSQ9NZJ4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SACSQ9NZJ4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SACSQ9NZJ4 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SACSQ9NZJ4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SACSQ9NZJ4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms