Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV6

RRN3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, humanhuman

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Length 651 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3Q9NYV6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RRN3Q9NYV6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RRN3Q9NYV6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RRN3Q9NYV6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RRN3Q9NYV6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RRN3Q9NYV6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RRN3Q9NYV6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RRN3Q9NYV6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RRN3Q9NYV6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RRN3Q9NYV6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RRN3Q9NYV6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RRN3Q9NYV6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RRN3Q9NYV6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RRN3Q9NYV6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RRN3Q9NYV6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RRN3Q9NYV6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RRN3Q9NYV6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RRN3Q9NYV6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RRN3Q9NYV6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RRN3Q9NYV6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RRN3Q9NYV6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RRN3Q9NYV6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RRN3Q9NYV6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RRN3Q9NYV6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RRN3Q9NYV6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RRN3Q9NYV6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RRN3Q9NYV6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RRN3Q9NYV6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RRN3Q9NYV6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RRN3Q9NYV6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RRN3Q9NYV6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RRN3Q9NYV6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RRN3Q9NYV6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RRN3Q9NYV6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RRN3Q9NYV6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RRN3Q9NYV6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RRN3Q9NYV6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RRN3Q9NYV6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RRN3Q9NYV6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RRN3Q9NYV6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RRN3Q9NYV6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RRN3Q9NYV6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RRN3Q9NYV6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RRN3Q9NYV6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RRN3Q9NYV6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RRN3Q9NYV6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RRN3Q9NYV6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RRN3Q9NYV6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RRN3Q9NYV6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RRN3Q9NYV6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RRN3Q9NYV6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RRN3Q9NYV6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RRN3Q9NYV6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RRN3Q9NYV6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRN3Q9NYV6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRN3Q9NYV6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRN3Q9NYV6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRN3Q9NYV6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRN3Q9NYV6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRN3Q9NYV6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRN3Q9NYV6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRN3Q9NYV6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRN3Q9NYV6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRN3Q9NYV6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRN3Q9NYV6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RRN3Q9NYV6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRN3Q9NYV6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RRN3Q9NYV6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRN3Q9NYV6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRN3Q9NYV6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRN3Q9NYV6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRN3Q9NYV6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRN3Q9NYV6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RRN3Q9NYV6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RRN3Q9NYV6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RRN3Q9NYV6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RRN3Q9NYV6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RRN3Q9NYV6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RRN3Q9NYV6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RRN3Q9NYV6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RRN3Q9NYV6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RRN3Q9NYV6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RRN3Q9NYV6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RRN3Q9NYV6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RRN3Q9NYV6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RRN3Q9NYV6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RRN3Q9NYV6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RRN3Q9NYV6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RRN3Q9NYV6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RRN3Q9NYV6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RRN3Q9NYV6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RRN3Q9NYV6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RRN3Q9NYV6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RRN3Q9NYV6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RRN3Q9NYV6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RRN3Q9NYV6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RRN3Q9NYV6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RRN3Q9NYV6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RRN3Q9NYV6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RRN3Q9NYV6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
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