Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VNN3Q9NY84 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VNN3Q9NY84 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VNN3Q9NY84 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VNN3Q9NY84 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VNN3Q9NY84 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VNN3Q9NY84 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VNN3Q9NY84 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VNN3Q9NY84 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
VNN3Q9NY84 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VNN3Q9NY84 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VNN3Q9NY84 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VNN3Q9NY84 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VNN3Q9NY84 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VNN3Q9NY84 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VNN3Q9NY84 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VNN3Q9NY84 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
VNN3Q9NY84 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VNN3Q9NY84 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VNN3Q9NY84 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VNN3Q9NY84 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VNN3Q9NY84 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
VNN3Q9NY84 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
VNN3Q9NY84 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
VNN3Q9NY84 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
VNN3Q9NY84 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
VNN3Q9NY84 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
VNN3Q9NY84 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VNN3Q9NY84 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VNN3Q9NY84 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VNN3Q9NY84 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VNN3Q9NY84 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VNN3Q9NY84 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VNN3Q9NY84 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VNN3Q9NY84 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VNN3Q9NY84 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VNN3Q9NY84 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VNN3Q9NY84 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VNN3Q9NY84 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VNN3Q9NY84 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VNN3Q9NY84 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VNN3Q9NY84 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VNN3Q9NY84 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VNN3Q9NY84 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VNN3Q9NY84 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VNN3Q9NY84 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VNN3Q9NY84 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VNN3Q9NY84 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VNN3Q9NY84 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VNN3Q9NY84 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VNN3Q9NY84 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VNN3Q9NY84 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VNN3Q9NY84 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VNN3Q9NY84 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VNN3Q9NY84 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VNN3Q9NY84 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VNN3Q9NY84 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VNN3Q9NY84 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VNN3Q9NY84 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VNN3Q9NY84 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VNN3Q9NY84 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
VNN3Q9NY84 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VNN3Q9NY84 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VNN3Q9NY84 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VNN3Q9NY84 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VNN3Q9NY84 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VNN3Q9NY84 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VNN3Q9NY84 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VNN3Q9NY84 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VNN3Q9NY84 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VNN3Q9NY84 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
VNN3Q9NY84 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VNN3Q9NY84 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VNN3Q9NY84 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VNN3Q9NY84 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VNN3Q9NY84 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VNN3Q9NY84 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VNN3Q9NY84 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VNN3Q9NY84 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VNN3Q9NY84 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VNN3Q9NY84 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VNN3Q9NY84 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VNN3Q9NY84 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VNN3Q9NY84 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VNN3Q9NY84 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VNN3Q9NY84 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
VNN3Q9NY84 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VNN3Q9NY84 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VNN3Q9NY84 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VNN3Q9NY84 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VNN3Q9NY84 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VNN3Q9NY84 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VNN3Q9NY84 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VNN3Q9NY84 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VNN3Q9NY84 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VNN3Q9NY84 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VNN3Q9NY84 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VNN3Q9NY84 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VNN3Q9NY84 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VNN3Q9NY84 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.4 ms