Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY59

SMPD3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD3Q9NY59 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMPD3Q9NY59 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMPD3Q9NY59 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMPD3Q9NY59 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMPD3Q9NY59 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMPD3Q9NY59 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMPD3Q9NY59 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMPD3Q9NY59 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMPD3Q9NY59 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMPD3Q9NY59 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMPD3Q9NY59 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMPD3Q9NY59 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMPD3Q9NY59 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMPD3Q9NY59 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMPD3Q9NY59 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMPD3Q9NY59 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMPD3Q9NY59 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMPD3Q9NY59 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMPD3Q9NY59 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMPD3Q9NY59 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMPD3Q9NY59 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMPD3Q9NY59 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMPD3Q9NY59 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMPD3Q9NY59 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMPD3Q9NY59 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMPD3Q9NY59 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMPD3Q9NY59 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMPD3Q9NY59 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMPD3Q9NY59 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMPD3Q9NY59 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMPD3Q9NY59 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMPD3Q9NY59 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMPD3Q9NY59 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMPD3Q9NY59 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMPD3Q9NY59 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMPD3Q9NY59 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMPD3Q9NY59 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SMPD3Q9NY59 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMPD3Q9NY59 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMPD3Q9NY59 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMPD3Q9NY59 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMPD3Q9NY59 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMPD3Q9NY59 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMPD3Q9NY59 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMPD3Q9NY59 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMPD3Q9NY59 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMPD3Q9NY59 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMPD3Q9NY59 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMPD3Q9NY59 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMPD3Q9NY59 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SMPD3Q9NY59 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMPD3Q9NY59 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMPD3Q9NY59 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMPD3Q9NY59 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMPD3Q9NY59 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMPD3Q9NY59 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMPD3Q9NY59 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMPD3Q9NY59 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMPD3Q9NY59 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMPD3Q9NY59 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMPD3Q9NY59 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMPD3Q9NY59 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMPD3Q9NY59 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMPD3Q9NY59 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMPD3Q9NY59 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMPD3Q9NY59 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMPD3Q9NY59 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMPD3Q9NY59 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMPD3Q9NY59 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMPD3Q9NY59 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMPD3Q9NY59 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SMPD3Q9NY59 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMPD3Q9NY59 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMPD3Q9NY59 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMPD3Q9NY59 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMPD3Q9NY59 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMPD3Q9NY59 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMPD3Q9NY59 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMPD3Q9NY59 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMPD3Q9NY59 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMPD3Q9NY59 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMPD3Q9NY59 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMPD3Q9NY59 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMPD3Q9NY59 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMPD3Q9NY59 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMPD3Q9NY59 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMPD3Q9NY59 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMPD3Q9NY59 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMPD3Q9NY59 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMPD3Q9NY59 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMPD3Q9NY59 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMPD3Q9NY59 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMPD3Q9NY59 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMPD3Q9NY59 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMPD3Q9NY59 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMPD3Q9NY59 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMPD3Q9NY59 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMPD3Q9NY59 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMPD3Q9NY59 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMPD3Q9NY59 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms