Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CACNA2D2Q9NY47 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CACNA2D2Q9NY47 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CACNA2D2Q9NY47 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CACNA2D2Q9NY47 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CACNA2D2Q9NY47 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA2D2Q9NY47 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA2D2Q9NY47 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA2D2Q9NY47 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA2D2Q9NY47 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA2D2Q9NY47 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA2D2Q9NY47 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA2D2Q9NY47 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA2D2Q9NY47 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA2D2Q9NY47 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA2D2Q9NY47 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA2D2Q9NY47 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA2D2Q9NY47 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA2D2Q9NY47 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA2D2Q9NY47 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA2D2Q9NY47 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA2D2Q9NY47 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA2D2Q9NY47 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA2D2Q9NY47 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA2D2Q9NY47 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA2D2Q9NY47 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA2D2Q9NY47 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA2D2Q9NY47 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA2D2Q9NY47 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA2D2Q9NY47 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA2D2Q9NY47 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA2D2Q9NY47 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA2D2Q9NY47 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA2D2Q9NY47 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA2D2Q9NY47 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA2D2Q9NY47 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA2D2Q9NY47 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA2D2Q9NY47 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA2D2Q9NY47 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA2D2Q9NY47 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA2D2Q9NY47 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA2D2Q9NY47 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA2D2Q9NY47 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA2D2Q9NY47 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA2D2Q9NY47 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA2D2Q9NY47 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA2D2Q9NY47 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA2D2Q9NY47 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA2D2Q9NY47 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA2D2Q9NY47 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA2D2Q9NY47 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA2D2Q9NY47 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA2D2Q9NY47 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA2D2Q9NY47 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA2D2Q9NY47 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA2D2Q9NY47 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA2D2Q9NY47 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA2D2Q9NY47 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA2D2Q9NY47 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA2D2Q9NY47 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA2D2Q9NY47 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA2D2Q9NY47 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA2D2Q9NY47 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA2D2Q9NY47 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA2D2Q9NY47 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA2D2Q9NY47 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA2D2Q9NY47 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA2D2Q9NY47 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA2D2Q9NY47 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA2D2Q9NY47 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA2D2Q9NY47 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA2D2Q9NY47 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA2D2Q9NY47 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA2D2Q9NY47 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA2D2Q9NY47 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA2D2Q9NY47 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA2D2Q9NY47 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA2D2Q9NY47 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA2D2Q9NY47 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA2D2Q9NY47 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA2D2Q9NY47 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA2D2Q9NY47 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA2D2Q9NY47 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA2D2Q9NY47 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA2D2Q9NY47 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA2D2Q9NY47 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA2D2Q9NY47 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA2D2Q9NY47 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA2D2Q9NY47 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA2D2Q9NY47 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA2D2Q9NY47 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA2D2Q9NY47 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA2D2Q9NY47 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA2D2Q9NY47 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA2D2Q9NY47 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms