Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXZ2

DDX43, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX43Q9NXZ2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX43Q9NXZ2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX43Q9NXZ2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX43Q9NXZ2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX43Q9NXZ2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX43Q9NXZ2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX43Q9NXZ2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DDX43Q9NXZ2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DDX43Q9NXZ2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
DDX43Q9NXZ2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
DDX43Q9NXZ2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX43Q9NXZ2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX43Q9NXZ2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX43Q9NXZ2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX43Q9NXZ2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX43Q9NXZ2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX43Q9NXZ2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX43Q9NXZ2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX43Q9NXZ2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX43Q9NXZ2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX43Q9NXZ2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX43Q9NXZ2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX43Q9NXZ2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX43Q9NXZ2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX43Q9NXZ2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX43Q9NXZ2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX43Q9NXZ2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX43Q9NXZ2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX43Q9NXZ2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX43Q9NXZ2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX43Q9NXZ2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX43Q9NXZ2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX43Q9NXZ2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX43Q9NXZ2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX43Q9NXZ2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX43Q9NXZ2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX43Q9NXZ2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX43Q9NXZ2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX43Q9NXZ2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX43Q9NXZ2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX43Q9NXZ2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX43Q9NXZ2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX43Q9NXZ2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX43Q9NXZ2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX43Q9NXZ2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX43Q9NXZ2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX43Q9NXZ2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX43Q9NXZ2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX43Q9NXZ2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX43Q9NXZ2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX43Q9NXZ2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX43Q9NXZ2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX43Q9NXZ2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX43Q9NXZ2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX43Q9NXZ2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX43Q9NXZ2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX43Q9NXZ2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX43Q9NXZ2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX43Q9NXZ2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX43Q9NXZ2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX43Q9NXZ2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX43Q9NXZ2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX43Q9NXZ2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX43Q9NXZ2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX43Q9NXZ2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX43Q9NXZ2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX43Q9NXZ2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX43Q9NXZ2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX43Q9NXZ2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX43Q9NXZ2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX43Q9NXZ2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX43Q9NXZ2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX43Q9NXZ2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX43Q9NXZ2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX43Q9NXZ2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX43Q9NXZ2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX43Q9NXZ2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX43Q9NXZ2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX43Q9NXZ2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX43Q9NXZ2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX43Q9NXZ2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DDX43Q9NXZ2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DDX43Q9NXZ2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DDX43Q9NXZ2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DDX43Q9NXZ2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms