Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXK8

FBXL12, F-box/LRR-repeat protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL12Q9NXK8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXL12Q9NXK8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXL12Q9NXK8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXL12Q9NXK8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXL12Q9NXK8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXL12Q9NXK8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXL12Q9NXK8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXL12Q9NXK8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXL12Q9NXK8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXL12Q9NXK8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXL12Q9NXK8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXL12Q9NXK8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXL12Q9NXK8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXL12Q9NXK8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXL12Q9NXK8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXL12Q9NXK8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXL12Q9NXK8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXL12Q9NXK8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXL12Q9NXK8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXL12Q9NXK8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXL12Q9NXK8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXL12Q9NXK8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXL12Q9NXK8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXL12Q9NXK8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXL12Q9NXK8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXL12Q9NXK8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXL12Q9NXK8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXL12Q9NXK8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXL12Q9NXK8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXL12Q9NXK8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXL12Q9NXK8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXL12Q9NXK8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXL12Q9NXK8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXL12Q9NXK8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXL12Q9NXK8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXL12Q9NXK8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXL12Q9NXK8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXL12Q9NXK8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXL12Q9NXK8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXL12Q9NXK8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXL12Q9NXK8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXL12Q9NXK8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXL12Q9NXK8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXL12Q9NXK8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXL12Q9NXK8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXL12Q9NXK8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXL12Q9NXK8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXL12Q9NXK8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXL12Q9NXK8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXL12Q9NXK8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXL12Q9NXK8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXL12Q9NXK8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXL12Q9NXK8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXL12Q9NXK8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXL12Q9NXK8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXL12Q9NXK8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXL12Q9NXK8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXL12Q9NXK8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXL12Q9NXK8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXL12Q9NXK8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXL12Q9NXK8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXL12Q9NXK8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXL12Q9NXK8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXL12Q9NXK8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXL12Q9NXK8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXL12Q9NXK8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXL12Q9NXK8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXL12Q9NXK8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXL12Q9NXK8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXL12Q9NXK8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXL12Q9NXK8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXL12Q9NXK8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXL12Q9NXK8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXL12Q9NXK8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXL12Q9NXK8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXL12Q9NXK8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXL12Q9NXK8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXL12Q9NXK8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXL12Q9NXK8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXL12Q9NXK8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXL12Q9NXK8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXL12Q9NXK8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXL12Q9NXK8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXL12Q9NXK8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXL12Q9NXK8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXL12Q9NXK8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXL12Q9NXK8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXL12Q9NXK8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXL12Q9NXK8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXL12Q9NXK8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXL12Q9NXK8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXL12Q9NXK8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXL12Q9NXK8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXL12Q9NXK8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXL12Q9NXK8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXL12Q9NXK8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXL12Q9NXK8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXL12Q9NXK8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXL12Q9NXK8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXL12Q9NXK8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms