Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX70

MED29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED29Q9NX70 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
MED29Q9NX70 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MED29Q9NX70 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MED29Q9NX70 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MED29Q9NX70 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MED29Q9NX70 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MED29Q9NX70 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MED29Q9NX70 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
MED29Q9NX70 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
MED29Q9NX70 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
MED29Q9NX70 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
MED29Q9NX70 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MED29Q9NX70 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MED29Q9NX70 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
MED29Q9NX70 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
MED29Q9NX70 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
MED29Q9NX70 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MED29Q9NX70 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MED29Q9NX70 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MED29Q9NX70 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MED29Q9NX70 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MED29Q9NX70 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MED29Q9NX70 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MED29Q9NX70 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
MED29Q9NX70 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MED29Q9NX70 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
MED29Q9NX70 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MED29Q9NX70 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MED29Q9NX70 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MED29Q9NX70 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MED29Q9NX70 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MED29Q9NX70 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MED29Q9NX70 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MED29Q9NX70 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MED29Q9NX70 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MED29Q9NX70 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MED29Q9NX70 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MED29Q9NX70 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MED29Q9NX70 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MED29Q9NX70 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MED29Q9NX70 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MED29Q9NX70 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MED29Q9NX70 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MED29Q9NX70 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MED29Q9NX70 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
MED29Q9NX70 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MED29Q9NX70 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MED29Q9NX70 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
MED29Q9NX70 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MED29Q9NX70 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MED29Q9NX70 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MED29Q9NX70 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MED29Q9NX70 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MED29Q9NX70 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MED29Q9NX70 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MED29Q9NX70 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MED29Q9NX70 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
MED29Q9NX70 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
MED29Q9NX70 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MED29Q9NX70 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MED29Q9NX70 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MED29Q9NX70 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MED29Q9NX70 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MED29Q9NX70 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MED29Q9NX70 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MED29Q9NX70 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MED29Q9NX70 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MED29Q9NX70 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MED29Q9NX70 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MED29Q9NX70 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MED29Q9NX70 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MED29Q9NX70 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MED29Q9NX70 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MED29Q9NX70 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MED29Q9NX70 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MED29Q9NX70 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MED29Q9NX70 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MED29Q9NX70 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
MED29Q9NX70 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MED29Q9NX70 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MED29Q9NX70 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MED29Q9NX70 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MED29Q9NX70 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MED29Q9NX70 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MED29Q9NX70 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
MED29Q9NX70 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MED29Q9NX70 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MED29Q9NX70 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MED29Q9NX70 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MED29Q9NX70 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
MED29Q9NX70 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
MED29Q9NX70 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MED29Q9NX70 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
MED29Q9NX70 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MED29Q9NX70 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
MED29Q9NX70 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MED29Q9NX70 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms