Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD3

SETD4, SET domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD4Q9NVD3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SETD4Q9NVD3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SETD4Q9NVD3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SETD4Q9NVD3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SETD4Q9NVD3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SETD4Q9NVD3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SETD4Q9NVD3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SETD4Q9NVD3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SETD4Q9NVD3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SETD4Q9NVD3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SETD4Q9NVD3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SETD4Q9NVD3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SETD4Q9NVD3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SETD4Q9NVD3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SETD4Q9NVD3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SETD4Q9NVD3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SETD4Q9NVD3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SETD4Q9NVD3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SETD4Q9NVD3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SETD4Q9NVD3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SETD4Q9NVD3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SETD4Q9NVD3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SETD4Q9NVD3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SETD4Q9NVD3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SETD4Q9NVD3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SETD4Q9NVD3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SETD4Q9NVD3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SETD4Q9NVD3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SETD4Q9NVD3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SETD4Q9NVD3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SETD4Q9NVD3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SETD4Q9NVD3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SETD4Q9NVD3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SETD4Q9NVD3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SETD4Q9NVD3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SETD4Q9NVD3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SETD4Q9NVD3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SETD4Q9NVD3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SETD4Q9NVD3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SETD4Q9NVD3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SETD4Q9NVD3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SETD4Q9NVD3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SETD4Q9NVD3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SETD4Q9NVD3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SETD4Q9NVD3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SETD4Q9NVD3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SETD4Q9NVD3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SETD4Q9NVD3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SETD4Q9NVD3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SETD4Q9NVD3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SETD4Q9NVD3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SETD4Q9NVD3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SETD4Q9NVD3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SETD4Q9NVD3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SETD4Q9NVD3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SETD4Q9NVD3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SETD4Q9NVD3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SETD4Q9NVD3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SETD4Q9NVD3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SETD4Q9NVD3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SETD4Q9NVD3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SETD4Q9NVD3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SETD4Q9NVD3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SETD4Q9NVD3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SETD4Q9NVD3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SETD4Q9NVD3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SETD4Q9NVD3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SETD4Q9NVD3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SETD4Q9NVD3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SETD4Q9NVD3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SETD4Q9NVD3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SETD4Q9NVD3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SETD4Q9NVD3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SETD4Q9NVD3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SETD4Q9NVD3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SETD4Q9NVD3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SETD4Q9NVD3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SETD4Q9NVD3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SETD4Q9NVD3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SETD4Q9NVD3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SETD4Q9NVD3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SETD4Q9NVD3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SETD4Q9NVD3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SETD4Q9NVD3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SETD4Q9NVD3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SETD4Q9NVD3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SETD4Q9NVD3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SETD4Q9NVD3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SETD4Q9NVD3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SETD4Q9NVD3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SETD4Q9NVD3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SETD4Q9NVD3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SETD4Q9NVD3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SETD4Q9NVD3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SETD4Q9NVD3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SETD4Q9NVD3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SETD4Q9NVD3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SETD4Q9NVD3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SETD4Q9NVD3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SETD4Q9NVD3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms