Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMBRD1Q9NUN5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMBRD1Q9NUN5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMBRD1Q9NUN5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LMBRD1Q9NUN5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMBRD1Q9NUN5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMBRD1Q9NUN5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMBRD1Q9NUN5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMBRD1Q9NUN5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMBRD1Q9NUN5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LMBRD1Q9NUN5 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMBRD1Q9NUN5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMBRD1Q9NUN5 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMBRD1Q9NUN5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMBRD1Q9NUN5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMBRD1Q9NUN5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMBRD1Q9NUN5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMBRD1Q9NUN5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMBRD1Q9NUN5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMBRD1Q9NUN5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMBRD1Q9NUN5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMBRD1Q9NUN5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMBRD1Q9NUN5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LMBRD1Q9NUN5 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMBRD1Q9NUN5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMBRD1Q9NUN5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMBRD1Q9NUN5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMBRD1Q9NUN5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMBRD1Q9NUN5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMBRD1Q9NUN5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LMBRD1Q9NUN5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMBRD1Q9NUN5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMBRD1Q9NUN5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMBRD1Q9NUN5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMBRD1Q9NUN5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMBRD1Q9NUN5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMBRD1Q9NUN5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMBRD1Q9NUN5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMBRD1Q9NUN5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMBRD1Q9NUN5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMBRD1Q9NUN5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMBRD1Q9NUN5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMBRD1Q9NUN5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMBRD1Q9NUN5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMBRD1Q9NUN5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMBRD1Q9NUN5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMBRD1Q9NUN5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMBRD1Q9NUN5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMBRD1Q9NUN5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMBRD1Q9NUN5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMBRD1Q9NUN5 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMBRD1Q9NUN5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LMBRD1Q9NUN5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMBRD1Q9NUN5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMBRD1Q9NUN5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMBRD1Q9NUN5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMBRD1Q9NUN5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMBRD1Q9NUN5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMBRD1Q9NUN5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMBRD1Q9NUN5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMBRD1Q9NUN5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMBRD1Q9NUN5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMBRD1Q9NUN5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMBRD1Q9NUN5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMBRD1Q9NUN5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LMBRD1Q9NUN5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMBRD1Q9NUN5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMBRD1Q9NUN5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMBRD1Q9NUN5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMBRD1Q9NUN5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMBRD1Q9NUN5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMBRD1Q9NUN5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMBRD1Q9NUN5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMBRD1Q9NUN5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMBRD1Q9NUN5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMBRD1Q9NUN5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMBRD1Q9NUN5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMBRD1Q9NUN5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMBRD1Q9NUN5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMBRD1Q9NUN5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMBRD1Q9NUN5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMBRD1Q9NUN5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMBRD1Q9NUN5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMBRD1Q9NUN5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMBRD1Q9NUN5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMBRD1Q9NUN5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMBRD1Q9NUN5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMBRD1Q9NUN5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LMBRD1Q9NUN5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LMBRD1Q9NUN5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMBRD1Q9NUN5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMBRD1Q9NUN5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMBRD1Q9NUN5 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMBRD1Q9NUN5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMBRD1Q9NUN5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMBRD1Q9NUN5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMBRD1Q9NUN5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMBRD1Q9NUN5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMBRD1Q9NUN5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMBRD1Q9NUN5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms