Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FOXD4L1Q9NU39 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FOXD4L1Q9NU39 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FOXD4L1Q9NU39 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FOXD4L1Q9NU39 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FOXD4L1Q9NU39 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
FOXD4L1Q9NU39 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
FOXD4L1Q9NU39 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXD4L1Q9NU39 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXD4L1Q9NU39 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXD4L1Q9NU39 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXD4L1Q9NU39 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXD4L1Q9NU39 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXD4L1Q9NU39 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXD4L1Q9NU39 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXD4L1Q9NU39 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXD4L1Q9NU39 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXD4L1Q9NU39 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FOXD4L1Q9NU39 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FOXD4L1Q9NU39 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FOXD4L1Q9NU39 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FOXD4L1Q9NU39 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FOXD4L1Q9NU39 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
FOXD4L1Q9NU39 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
FOXD4L1Q9NU39 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOXD4L1Q9NU39 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOXD4L1Q9NU39 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOXD4L1Q9NU39 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOXD4L1Q9NU39 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOXD4L1Q9NU39 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOXD4L1Q9NU39 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
FOXD4L1Q9NU39 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOXD4L1Q9NU39 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOXD4L1Q9NU39 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOXD4L1Q9NU39 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOXD4L1Q9NU39 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOXD4L1Q9NU39 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOXD4L1Q9NU39 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOXD4L1Q9NU39 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FOXD4L1Q9NU39 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FOXD4L1Q9NU39 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FOXD4L1Q9NU39 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FOXD4L1Q9NU39 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FOXD4L1Q9NU39 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FOXD4L1Q9NU39 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FOXD4L1Q9NU39 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
FOXD4L1Q9NU39 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FOXD4L1Q9NU39 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FOXD4L1Q9NU39 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
FOXD4L1Q9NU39 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FOXD4L1Q9NU39 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FOXD4L1Q9NU39 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FOXD4L1Q9NU39 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FOXD4L1Q9NU39 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FOXD4L1Q9NU39 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FOXD4L1Q9NU39 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FOXD4L1Q9NU39 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FOXD4L1Q9NU39 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FOXD4L1Q9NU39 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FOXD4L1Q9NU39 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FOXD4L1Q9NU39 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FOXD4L1Q9NU39 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FOXD4L1Q9NU39 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FOXD4L1Q9NU39 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FOXD4L1Q9NU39 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FOXD4L1Q9NU39 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FOXD4L1Q9NU39 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FOXD4L1Q9NU39 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FOXD4L1Q9NU39 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FOXD4L1Q9NU39 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FOXD4L1Q9NU39 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FOXD4L1Q9NU39 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FOXD4L1Q9NU39 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FOXD4L1Q9NU39 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FOXD4L1Q9NU39 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FOXD4L1Q9NU39 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
FOXD4L1Q9NU39 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
FOXD4L1Q9NU39 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FOXD4L1Q9NU39 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FOXD4L1Q9NU39 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FOXD4L1Q9NU39 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FOXD4L1Q9NU39 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
FOXD4L1Q9NU39 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
FOXD4L1Q9NU39 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FOXD4L1Q9NU39 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FOXD4L1Q9NU39 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FOXD4L1Q9NU39 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FOXD4L1Q9NU39 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FOXD4L1Q9NU39 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FOXD4L1Q9NU39 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FOXD4L1Q9NU39 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FOXD4L1Q9NU39 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FOXD4L1Q9NU39 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FOXD4L1Q9NU39 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FOXD4L1Q9NU39 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FOXD4L1Q9NU39 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FOXD4L1Q9NU39 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FOXD4L1Q9NU39 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FOXD4L1Q9NU39 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FOXD4L1Q9NU39 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms