Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA2

KCND1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCND1Q9NSA2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCND1Q9NSA2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCND1Q9NSA2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
KCND1Q9NSA2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCND1Q9NSA2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCND1Q9NSA2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCND1Q9NSA2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCND1Q9NSA2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCND1Q9NSA2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KCND1Q9NSA2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCND1Q9NSA2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCND1Q9NSA2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCND1Q9NSA2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCND1Q9NSA2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCND1Q9NSA2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCND1Q9NSA2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCND1Q9NSA2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCND1Q9NSA2 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCND1Q9NSA2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCND1Q9NSA2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCND1Q9NSA2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCND1Q9NSA2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCND1Q9NSA2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCND1Q9NSA2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KCND1Q9NSA2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCND1Q9NSA2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCND1Q9NSA2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCND1Q9NSA2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KCND1Q9NSA2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCND1Q9NSA2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KCND1Q9NSA2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCND1Q9NSA2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KCND1Q9NSA2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCND1Q9NSA2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCND1Q9NSA2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCND1Q9NSA2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCND1Q9NSA2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCND1Q9NSA2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCND1Q9NSA2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCND1Q9NSA2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCND1Q9NSA2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCND1Q9NSA2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KCND1Q9NSA2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCND1Q9NSA2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCND1Q9NSA2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCND1Q9NSA2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCND1Q9NSA2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCND1Q9NSA2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCND1Q9NSA2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCND1Q9NSA2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCND1Q9NSA2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCND1Q9NSA2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCND1Q9NSA2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCND1Q9NSA2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCND1Q9NSA2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
KCND1Q9NSA2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCND1Q9NSA2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCND1Q9NSA2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCND1Q9NSA2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCND1Q9NSA2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCND1Q9NSA2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCND1Q9NSA2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCND1Q9NSA2 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCND1Q9NSA2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCND1Q9NSA2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCND1Q9NSA2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCND1Q9NSA2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
KCND1Q9NSA2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCND1Q9NSA2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCND1Q9NSA2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCND1Q9NSA2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCND1Q9NSA2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KCND1Q9NSA2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KCND1Q9NSA2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KCND1Q9NSA2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KCND1Q9NSA2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KCND1Q9NSA2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KCND1Q9NSA2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
KCND1Q9NSA2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCND1Q9NSA2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCND1Q9NSA2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCND1Q9NSA2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
KCND1Q9NSA2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCND1Q9NSA2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCND1Q9NSA2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCND1Q9NSA2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCND1Q9NSA2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCND1Q9NSA2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCND1Q9NSA2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCND1Q9NSA2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCND1Q9NSA2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCND1Q9NSA2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCND1Q9NSA2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCND1Q9NSA2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCND1Q9NSA2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCND1Q9NSA2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCND1Q9NSA2 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCND1Q9NSA2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCND1Q9NSA2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCND1Q9NSA2 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 195.1 ms