Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS68

TNFRSF19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF19Q9NS68 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFRSF19Q9NS68 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFRSF19Q9NS68 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFRSF19Q9NS68 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFRSF19Q9NS68 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFRSF19Q9NS68 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFRSF19Q9NS68 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFRSF19Q9NS68 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFRSF19Q9NS68 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFRSF19Q9NS68 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFRSF19Q9NS68 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFRSF19Q9NS68 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFRSF19Q9NS68 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFRSF19Q9NS68 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFRSF19Q9NS68 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFRSF19Q9NS68 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFRSF19Q9NS68 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFRSF19Q9NS68 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFRSF19Q9NS68 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFRSF19Q9NS68 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFRSF19Q9NS68 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFRSF19Q9NS68 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFRSF19Q9NS68 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFRSF19Q9NS68 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFRSF19Q9NS68 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFRSF19Q9NS68 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNFRSF19Q9NS68 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNFRSF19Q9NS68 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TNFRSF19Q9NS68 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TNFRSF19Q9NS68 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNFRSF19Q9NS68 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNFRSF19Q9NS68 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNFRSF19Q9NS68 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNFRSF19Q9NS68 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNFRSF19Q9NS68 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNFRSF19Q9NS68 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TNFRSF19Q9NS68 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TNFRSF19Q9NS68 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TNFRSF19Q9NS68 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TNFRSF19Q9NS68 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TNFRSF19Q9NS68 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TNFRSF19Q9NS68 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TNFRSF19Q9NS68 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TNFRSF19Q9NS68 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TNFRSF19Q9NS68 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TNFRSF19Q9NS68 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TNFRSF19Q9NS68 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TNFRSF19Q9NS68 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TNFRSF19Q9NS68 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TNFRSF19Q9NS68 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms