Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRU3

CNNM1, Metal transporter CNNM1, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM1Q9NRU3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CNNM1Q9NRU3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNNM1Q9NRU3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNNM1Q9NRU3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNNM1Q9NRU3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNNM1Q9NRU3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNNM1Q9NRU3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNNM1Q9NRU3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CNNM1Q9NRU3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNNM1Q9NRU3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNNM1Q9NRU3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNNM1Q9NRU3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNNM1Q9NRU3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNNM1Q9NRU3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNNM1Q9NRU3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNNM1Q9NRU3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNNM1Q9NRU3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNNM1Q9NRU3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNNM1Q9NRU3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNNM1Q9NRU3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNNM1Q9NRU3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNNM1Q9NRU3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNNM1Q9NRU3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNNM1Q9NRU3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNNM1Q9NRU3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNNM1Q9NRU3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNNM1Q9NRU3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNNM1Q9NRU3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNNM1Q9NRU3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CNNM1Q9NRU3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CNNM1Q9NRU3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CNNM1Q9NRU3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CNNM1Q9NRU3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CNNM1Q9NRU3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CNNM1Q9NRU3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CNNM1Q9NRU3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CNNM1Q9NRU3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CNNM1Q9NRU3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNNM1Q9NRU3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNNM1Q9NRU3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNNM1Q9NRU3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNNM1Q9NRU3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNNM1Q9NRU3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNNM1Q9NRU3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNNM1Q9NRU3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNNM1Q9NRU3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNNM1Q9NRU3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNNM1Q9NRU3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNNM1Q9NRU3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNNM1Q9NRU3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNNM1Q9NRU3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNNM1Q9NRU3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CNNM1Q9NRU3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNNM1Q9NRU3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNNM1Q9NRU3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CNNM1Q9NRU3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CNNM1Q9NRU3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNNM1Q9NRU3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNNM1Q9NRU3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNNM1Q9NRU3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNNM1Q9NRU3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNNM1Q9NRU3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNNM1Q9NRU3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNNM1Q9NRU3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNNM1Q9NRU3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNNM1Q9NRU3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNNM1Q9NRU3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNNM1Q9NRU3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNNM1Q9NRU3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNNM1Q9NRU3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNNM1Q9NRU3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNNM1Q9NRU3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNNM1Q9NRU3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNNM1Q9NRU3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNNM1Q9NRU3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNNM1Q9NRU3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNNM1Q9NRU3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNNM1Q9NRU3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNNM1Q9NRU3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNNM1Q9NRU3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNNM1Q9NRU3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNNM1Q9NRU3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNNM1Q9NRU3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNNM1Q9NRU3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNNM1Q9NRU3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNNM1Q9NRU3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CNNM1Q9NRU3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNNM1Q9NRU3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNNM1Q9NRU3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNNM1Q9NRU3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNNM1Q9NRU3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNNM1Q9NRU3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNNM1Q9NRU3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNNM1Q9NRU3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CNNM1Q9NRU3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNNM1Q9NRU3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNNM1Q9NRU3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNNM1Q9NRU3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CNNM1Q9NRU3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNNM1Q9NRU3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms