Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMPRSS4Q9NRS4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMPRSS4Q9NRS4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMPRSS4Q9NRS4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMPRSS4Q9NRS4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMPRSS4Q9NRS4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMPRSS4Q9NRS4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TMPRSS4Q9NRS4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMPRSS4Q9NRS4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMPRSS4Q9NRS4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMPRSS4Q9NRS4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMPRSS4Q9NRS4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMPRSS4Q9NRS4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMPRSS4Q9NRS4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMPRSS4Q9NRS4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMPRSS4Q9NRS4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMPRSS4Q9NRS4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMPRSS4Q9NRS4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMPRSS4Q9NRS4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMPRSS4Q9NRS4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMPRSS4Q9NRS4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMPRSS4Q9NRS4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMPRSS4Q9NRS4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMPRSS4Q9NRS4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMPRSS4Q9NRS4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMPRSS4Q9NRS4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMPRSS4Q9NRS4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMPRSS4Q9NRS4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMPRSS4Q9NRS4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMPRSS4Q9NRS4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMPRSS4Q9NRS4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMPRSS4Q9NRS4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMPRSS4Q9NRS4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMPRSS4Q9NRS4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMPRSS4Q9NRS4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMPRSS4Q9NRS4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMPRSS4Q9NRS4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMPRSS4Q9NRS4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TMPRSS4Q9NRS4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMPRSS4Q9NRS4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMPRSS4Q9NRS4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMPRSS4Q9NRS4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMPRSS4Q9NRS4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMPRSS4Q9NRS4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TMPRSS4Q9NRS4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMPRSS4Q9NRS4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMPRSS4Q9NRS4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMPRSS4Q9NRS4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMPRSS4Q9NRS4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMPRSS4Q9NRS4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMPRSS4Q9NRS4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMPRSS4Q9NRS4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TMPRSS4Q9NRS4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMPRSS4Q9NRS4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMPRSS4Q9NRS4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMPRSS4Q9NRS4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMPRSS4Q9NRS4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMPRSS4Q9NRS4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMPRSS4Q9NRS4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMPRSS4Q9NRS4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMPRSS4Q9NRS4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMPRSS4Q9NRS4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TMPRSS4Q9NRS4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TMPRSS4Q9NRS4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMPRSS4Q9NRS4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TMPRSS4Q9NRS4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMPRSS4Q9NRS4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMPRSS4Q9NRS4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMPRSS4Q9NRS4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMPRSS4Q9NRS4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMPRSS4Q9NRS4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMPRSS4Q9NRS4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMPRSS4Q9NRS4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMPRSS4Q9NRS4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMPRSS4Q9NRS4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMPRSS4Q9NRS4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMPRSS4Q9NRS4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TMPRSS4Q9NRS4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMPRSS4Q9NRS4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMPRSS4Q9NRS4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMPRSS4Q9NRS4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMPRSS4Q9NRS4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMPRSS4Q9NRS4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMPRSS4Q9NRS4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMPRSS4Q9NRS4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMPRSS4Q9NRS4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMPRSS4Q9NRS4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMPRSS4Q9NRS4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMPRSS4Q9NRS4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TMPRSS4Q9NRS4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMPRSS4Q9NRS4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMPRSS4Q9NRS4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMPRSS4Q9NRS4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMPRSS4Q9NRS4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMPRSS4Q9NRS4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMPRSS4Q9NRS4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMPRSS4Q9NRS4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMPRSS4Q9NRS4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMPRSS4Q9NRS4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMPRSS4Q9NRS4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms