Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP85

NPHS2, Podocin, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHS2Q9NP85 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NPHS2Q9NP85 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NPHS2Q9NP85 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NPHS2Q9NP85 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NPHS2Q9NP85 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NPHS2Q9NP85 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NPHS2Q9NP85 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NPHS2Q9NP85 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NPHS2Q9NP85 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NPHS2Q9NP85 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NPHS2Q9NP85 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NPHS2Q9NP85 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NPHS2Q9NP85 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NPHS2Q9NP85 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NPHS2Q9NP85 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NPHS2Q9NP85 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NPHS2Q9NP85 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NPHS2Q9NP85 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NPHS2Q9NP85 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NPHS2Q9NP85 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NPHS2Q9NP85 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NPHS2Q9NP85 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NPHS2Q9NP85 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NPHS2Q9NP85 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NPHS2Q9NP85 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NPHS2Q9NP85 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NPHS2Q9NP85 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NPHS2Q9NP85 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NPHS2Q9NP85 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NPHS2Q9NP85 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NPHS2Q9NP85 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NPHS2Q9NP85 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NPHS2Q9NP85 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NPHS2Q9NP85 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NPHS2Q9NP85 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NPHS2Q9NP85 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NPHS2Q9NP85 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NPHS2Q9NP85 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NPHS2Q9NP85 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NPHS2Q9NP85 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NPHS2Q9NP85 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NPHS2Q9NP85 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NPHS2Q9NP85 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NPHS2Q9NP85 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NPHS2Q9NP85 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NPHS2Q9NP85 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NPHS2Q9NP85 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NPHS2Q9NP85 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NPHS2Q9NP85 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NPHS2Q9NP85 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NPHS2Q9NP85 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NPHS2Q9NP85 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NPHS2Q9NP85 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NPHS2Q9NP85 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NPHS2Q9NP85 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NPHS2Q9NP85 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NPHS2Q9NP85 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NPHS2Q9NP85 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NPHS2Q9NP85 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NPHS2Q9NP85 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NPHS2Q9NP85 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NPHS2Q9NP85 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NPHS2Q9NP85 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NPHS2Q9NP85 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NPHS2Q9NP85 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NPHS2Q9NP85 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NPHS2Q9NP85 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NPHS2Q9NP85 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NPHS2Q9NP85 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NPHS2Q9NP85 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NPHS2Q9NP85 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NPHS2Q9NP85 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NPHS2Q9NP85 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NPHS2Q9NP85 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NPHS2Q9NP85 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NPHS2Q9NP85 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NPHS2Q9NP85 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NPHS2Q9NP85 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NPHS2Q9NP85 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NPHS2Q9NP85 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NPHS2Q9NP85 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NPHS2Q9NP85 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPHS2Q9NP85 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPHS2Q9NP85 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPHS2Q9NP85 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPHS2Q9NP85 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPHS2Q9NP85 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NPHS2Q9NP85 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPHS2Q9NP85 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPHS2Q9NP85 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPHS2Q9NP85 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPHS2Q9NP85 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPHS2Q9NP85 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPHS2Q9NP85 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPHS2Q9NP85 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPHS2Q9NP85 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPHS2Q9NP85 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPHS2Q9NP85 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPHS2Q9NP85 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPHS2Q9NP85 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms