Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX9

VCX3A, Variable charge X-linked protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCX3AQ9NNX9 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VCX3AQ9NNX9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VCX3AQ9NNX9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VCX3AQ9NNX9 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VCX3AQ9NNX9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VCX3AQ9NNX9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VCX3AQ9NNX9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VCX3AQ9NNX9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VCX3AQ9NNX9 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VCX3AQ9NNX9 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VCX3AQ9NNX9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
VCX3AQ9NNX9 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VCX3AQ9NNX9 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VCX3AQ9NNX9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VCX3AQ9NNX9 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VCX3AQ9NNX9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VCX3AQ9NNX9 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VCX3AQ9NNX9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VCX3AQ9NNX9 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VCX3AQ9NNX9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VCX3AQ9NNX9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VCX3AQ9NNX9 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VCX3AQ9NNX9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VCX3AQ9NNX9 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VCX3AQ9NNX9 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VCX3AQ9NNX9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VCX3AQ9NNX9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VCX3AQ9NNX9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VCX3AQ9NNX9 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VCX3AQ9NNX9 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VCX3AQ9NNX9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VCX3AQ9NNX9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VCX3AQ9NNX9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VCX3AQ9NNX9 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VCX3AQ9NNX9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VCX3AQ9NNX9 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VCX3AQ9NNX9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VCX3AQ9NNX9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VCX3AQ9NNX9 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VCX3AQ9NNX9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VCX3AQ9NNX9 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VCX3AQ9NNX9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VCX3AQ9NNX9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VCX3AQ9NNX9 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VCX3AQ9NNX9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VCX3AQ9NNX9 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VCX3AQ9NNX9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VCX3AQ9NNX9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VCX3AQ9NNX9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VCX3AQ9NNX9 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VCX3AQ9NNX9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VCX3AQ9NNX9 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VCX3AQ9NNX9 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VCX3AQ9NNX9 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VCX3AQ9NNX9 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VCX3AQ9NNX9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VCX3AQ9NNX9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VCX3AQ9NNX9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VCX3AQ9NNX9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
VCX3AQ9NNX9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VCX3AQ9NNX9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VCX3AQ9NNX9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VCX3AQ9NNX9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VCX3AQ9NNX9 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VCX3AQ9NNX9 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VCX3AQ9NNX9 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VCX3AQ9NNX9 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VCX3AQ9NNX9 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VCX3AQ9NNX9 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VCX3AQ9NNX9 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VCX3AQ9NNX9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VCX3AQ9NNX9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VCX3AQ9NNX9 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VCX3AQ9NNX9 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VCX3AQ9NNX9 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VCX3AQ9NNX9 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VCX3AQ9NNX9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VCX3AQ9NNX9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VCX3AQ9NNX9 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VCX3AQ9NNX9 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VCX3AQ9NNX9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VCX3AQ9NNX9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VCX3AQ9NNX9 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VCX3AQ9NNX9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VCX3AQ9NNX9 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VCX3AQ9NNX9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VCX3AQ9NNX9 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VCX3AQ9NNX9 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VCX3AQ9NNX9 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VCX3AQ9NNX9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VCX3AQ9NNX9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VCX3AQ9NNX9 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VCX3AQ9NNX9 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VCX3AQ9NNX9 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VCX3AQ9NNX9 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VCX3AQ9NNX9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VCX3AQ9NNX9 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VCX3AQ9NNX9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VCX3AQ9NNX9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VCX3AQ9NNX9 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms