Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CYP4F12Q9HCS2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP4F12Q9HCS2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP4F12Q9HCS2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP4F12Q9HCS2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP4F12Q9HCS2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP4F12Q9HCS2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP4F12Q9HCS2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP4F12Q9HCS2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP4F12Q9HCS2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP4F12Q9HCS2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP4F12Q9HCS2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP4F12Q9HCS2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP4F12Q9HCS2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP4F12Q9HCS2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP4F12Q9HCS2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP4F12Q9HCS2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP4F12Q9HCS2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP4F12Q9HCS2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP4F12Q9HCS2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP4F12Q9HCS2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP4F12Q9HCS2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP4F12Q9HCS2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP4F12Q9HCS2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP4F12Q9HCS2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP4F12Q9HCS2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP4F12Q9HCS2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP4F12Q9HCS2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP4F12Q9HCS2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms