Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM2

PLXNA4, Plexin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA4Q9HCM2 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLXNA4Q9HCM2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLXNA4Q9HCM2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PLXNA4Q9HCM2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLXNA4Q9HCM2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLXNA4Q9HCM2 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PLXNA4Q9HCM2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLXNA4Q9HCM2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLXNA4Q9HCM2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLXNA4Q9HCM2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLXNA4Q9HCM2 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLXNA4Q9HCM2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLXNA4Q9HCM2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLXNA4Q9HCM2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLXNA4Q9HCM2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLXNA4Q9HCM2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLXNA4Q9HCM2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLXNA4Q9HCM2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLXNA4Q9HCM2 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PLXNA4Q9HCM2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLXNA4Q9HCM2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLXNA4Q9HCM2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLXNA4Q9HCM2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLXNA4Q9HCM2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PLXNA4Q9HCM2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PLXNA4Q9HCM2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PLXNA4Q9HCM2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PLXNA4Q9HCM2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLXNA4Q9HCM2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLXNA4Q9HCM2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLXNA4Q9HCM2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLXNA4Q9HCM2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLXNA4Q9HCM2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLXNA4Q9HCM2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLXNA4Q9HCM2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLXNA4Q9HCM2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLXNA4Q9HCM2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLXNA4Q9HCM2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLXNA4Q9HCM2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLXNA4Q9HCM2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PLXNA4Q9HCM2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLXNA4Q9HCM2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLXNA4Q9HCM2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLXNA4Q9HCM2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLXNA4Q9HCM2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLXNA4Q9HCM2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLXNA4Q9HCM2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLXNA4Q9HCM2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLXNA4Q9HCM2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLXNA4Q9HCM2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLXNA4Q9HCM2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLXNA4Q9HCM2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLXNA4Q9HCM2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLXNA4Q9HCM2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLXNA4Q9HCM2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLXNA4Q9HCM2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLXNA4Q9HCM2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLXNA4Q9HCM2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLXNA4Q9HCM2 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLXNA4Q9HCM2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLXNA4Q9HCM2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PLXNA4Q9HCM2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PLXNA4Q9HCM2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLXNA4Q9HCM2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLXNA4Q9HCM2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLXNA4Q9HCM2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLXNA4Q9HCM2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXNA4Q9HCM2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXNA4Q9HCM2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXNA4Q9HCM2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXNA4Q9HCM2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXNA4Q9HCM2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXNA4Q9HCM2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXNA4Q9HCM2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXNA4Q9HCM2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXNA4Q9HCM2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXNA4Q9HCM2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXNA4Q9HCM2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXNA4Q9HCM2 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXNA4Q9HCM2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXNA4Q9HCM2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXNA4Q9HCM2 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXNA4Q9HCM2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXNA4Q9HCM2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLXNA4Q9HCM2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLXNA4Q9HCM2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLXNA4Q9HCM2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLXNA4Q9HCM2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLXNA4Q9HCM2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLXNA4Q9HCM2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLXNA4Q9HCM2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLXNA4Q9HCM2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLXNA4Q9HCM2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLXNA4Q9HCM2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLXNA4Q9HCM2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLXNA4Q9HCM2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLXNA4Q9HCM2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLXNA4Q9HCM2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLXNA4Q9HCM2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLXNA4Q9HCM2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms