Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC52

CBX8, Chromobox protein homolog 8, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX8Q9HC52 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CBX8Q9HC52 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CBX8Q9HC52 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CBX8Q9HC52 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CBX8Q9HC52 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CBX8Q9HC52 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CBX8Q9HC52 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CBX8Q9HC52 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CBX8Q9HC52 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CBX8Q9HC52 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CBX8Q9HC52 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CBX8Q9HC52 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CBX8Q9HC52 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CBX8Q9HC52 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CBX8Q9HC52 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CBX8Q9HC52 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CBX8Q9HC52 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CBX8Q9HC52 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CBX8Q9HC52 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CBX8Q9HC52 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CBX8Q9HC52 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CBX8Q9HC52 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CBX8Q9HC52 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CBX8Q9HC52 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CBX8Q9HC52 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CBX8Q9HC52 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CBX8Q9HC52 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CBX8Q9HC52 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CBX8Q9HC52 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CBX8Q9HC52 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CBX8Q9HC52 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CBX8Q9HC52 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CBX8Q9HC52 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CBX8Q9HC52 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CBX8Q9HC52 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CBX8Q9HC52 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CBX8Q9HC52 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CBX8Q9HC52 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CBX8Q9HC52 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CBX8Q9HC52 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CBX8Q9HC52 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CBX8Q9HC52 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CBX8Q9HC52 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CBX8Q9HC52 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CBX8Q9HC52 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CBX8Q9HC52 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CBX8Q9HC52 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CBX8Q9HC52 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CBX8Q9HC52 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CBX8Q9HC52 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CBX8Q9HC52 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CBX8Q9HC52 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CBX8Q9HC52 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CBX8Q9HC52 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CBX8Q9HC52 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CBX8Q9HC52 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CBX8Q9HC52 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CBX8Q9HC52 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CBX8Q9HC52 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CBX8Q9HC52 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CBX8Q9HC52 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CBX8Q9HC52 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CBX8Q9HC52 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CBX8Q9HC52 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CBX8Q9HC52 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CBX8Q9HC52 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CBX8Q9HC52 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CBX8Q9HC52 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CBX8Q9HC52 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CBX8Q9HC52 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CBX8Q9HC52 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CBX8Q9HC52 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CBX8Q9HC52 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CBX8Q9HC52 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CBX8Q9HC52 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CBX8Q9HC52 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CBX8Q9HC52 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CBX8Q9HC52 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CBX8Q9HC52 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CBX8Q9HC52 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CBX8Q9HC52 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CBX8Q9HC52 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CBX8Q9HC52 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CBX8Q9HC52 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CBX8Q9HC52 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CBX8Q9HC52 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CBX8Q9HC52 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CBX8Q9HC52 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CBX8Q9HC52 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CBX8Q9HC52 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CBX8Q9HC52 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CBX8Q9HC52 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CBX8Q9HC52 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CBX8Q9HC52 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CBX8Q9HC52 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CBX8Q9HC52 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CBX8Q9HC52 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CBX8Q9HC52 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CBX8Q9HC52 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CBX8Q9HC52 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms