Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAS3

SLC28A3, Solute carrier family 28 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A3Q9HAS3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC28A3Q9HAS3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC28A3Q9HAS3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC28A3Q9HAS3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC28A3Q9HAS3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC28A3Q9HAS3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC28A3Q9HAS3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC28A3Q9HAS3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC28A3Q9HAS3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC28A3Q9HAS3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC28A3Q9HAS3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC28A3Q9HAS3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC28A3Q9HAS3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC28A3Q9HAS3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC28A3Q9HAS3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC28A3Q9HAS3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC28A3Q9HAS3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC28A3Q9HAS3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC28A3Q9HAS3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC28A3Q9HAS3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC28A3Q9HAS3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC28A3Q9HAS3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC28A3Q9HAS3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC28A3Q9HAS3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC28A3Q9HAS3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC28A3Q9HAS3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC28A3Q9HAS3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC28A3Q9HAS3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC28A3Q9HAS3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC28A3Q9HAS3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC28A3Q9HAS3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC28A3Q9HAS3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC28A3Q9HAS3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC28A3Q9HAS3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC28A3Q9HAS3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC28A3Q9HAS3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC28A3Q9HAS3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC28A3Q9HAS3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC28A3Q9HAS3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC28A3Q9HAS3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC28A3Q9HAS3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC28A3Q9HAS3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC28A3Q9HAS3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC28A3Q9HAS3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC28A3Q9HAS3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC28A3Q9HAS3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC28A3Q9HAS3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC28A3Q9HAS3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC28A3Q9HAS3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC28A3Q9HAS3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC28A3Q9HAS3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC28A3Q9HAS3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC28A3Q9HAS3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC28A3Q9HAS3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC28A3Q9HAS3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC28A3Q9HAS3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC28A3Q9HAS3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC28A3Q9HAS3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC28A3Q9HAS3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC28A3Q9HAS3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC28A3Q9HAS3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC28A3Q9HAS3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC28A3Q9HAS3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC28A3Q9HAS3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC28A3Q9HAS3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC28A3Q9HAS3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC28A3Q9HAS3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC28A3Q9HAS3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC28A3Q9HAS3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC28A3Q9HAS3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC28A3Q9HAS3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC28A3Q9HAS3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC28A3Q9HAS3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC28A3Q9HAS3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC28A3Q9HAS3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC28A3Q9HAS3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC28A3Q9HAS3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC28A3Q9HAS3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC28A3Q9HAS3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC28A3Q9HAS3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC28A3Q9HAS3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC28A3Q9HAS3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC28A3Q9HAS3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC28A3Q9HAS3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC28A3Q9HAS3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC28A3Q9HAS3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC28A3Q9HAS3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC28A3Q9HAS3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC28A3Q9HAS3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC28A3Q9HAS3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC28A3Q9HAS3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC28A3Q9HAS3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC28A3Q9HAS3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC28A3Q9HAS3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC28A3Q9HAS3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC28A3Q9HAS3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC28A3Q9HAS3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC28A3Q9HAS3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC28A3Q9HAS3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC28A3Q9HAS3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms