Protein–RNA interactions for Protein: Q9H902

REEP1, Receptor expression-enhancing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP1Q9H902 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
REEP1Q9H902 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
REEP1Q9H902 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
REEP1Q9H902 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
REEP1Q9H902 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
REEP1Q9H902 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
REEP1Q9H902 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
REEP1Q9H902 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
REEP1Q9H902 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
REEP1Q9H902 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
REEP1Q9H902 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
REEP1Q9H902 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
REEP1Q9H902 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
REEP1Q9H902 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
REEP1Q9H902 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
REEP1Q9H902 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
REEP1Q9H902 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
REEP1Q9H902 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
REEP1Q9H902 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
REEP1Q9H902 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
REEP1Q9H902 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
REEP1Q9H902 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
REEP1Q9H902 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
REEP1Q9H902 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
REEP1Q9H902 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
REEP1Q9H902 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
REEP1Q9H902 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
REEP1Q9H902 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
REEP1Q9H902 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
REEP1Q9H902 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
REEP1Q9H902 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
REEP1Q9H902 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
REEP1Q9H902 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
REEP1Q9H902 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
REEP1Q9H902 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
REEP1Q9H902 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
REEP1Q9H902 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
REEP1Q9H902 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
REEP1Q9H902 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
REEP1Q9H902 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
REEP1Q9H902 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
REEP1Q9H902 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
REEP1Q9H902 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
REEP1Q9H902 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
REEP1Q9H902 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
REEP1Q9H902 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
REEP1Q9H902 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
REEP1Q9H902 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
REEP1Q9H902 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
REEP1Q9H902 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
REEP1Q9H902 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
REEP1Q9H902 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
REEP1Q9H902 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
REEP1Q9H902 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
REEP1Q9H902 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
REEP1Q9H902 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
REEP1Q9H902 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
REEP1Q9H902 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
REEP1Q9H902 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
REEP1Q9H902 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
REEP1Q9H902 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
REEP1Q9H902 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
REEP1Q9H902 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
REEP1Q9H902 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
REEP1Q9H902 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
REEP1Q9H902 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
REEP1Q9H902 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
REEP1Q9H902 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
REEP1Q9H902 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
REEP1Q9H902 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
REEP1Q9H902 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
REEP1Q9H902 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
REEP1Q9H902 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
REEP1Q9H902 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
REEP1Q9H902 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
REEP1Q9H902 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
REEP1Q9H902 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
REEP1Q9H902 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
REEP1Q9H902 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
REEP1Q9H902 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
REEP1Q9H902 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
REEP1Q9H902 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
REEP1Q9H902 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
REEP1Q9H902 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
REEP1Q9H902 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
REEP1Q9H902 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
REEP1Q9H902 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
REEP1Q9H902 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
REEP1Q9H902 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
REEP1Q9H902 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
REEP1Q9H902 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
REEP1Q9H902 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
REEP1Q9H902 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
REEP1Q9H902 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
REEP1Q9H902 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
REEP1Q9H902 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
REEP1Q9H902 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
REEP1Q9H902 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
REEP1Q9H902 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
REEP1Q9H902 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms