Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7F0

ATP13A3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A3Q9H7F0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP13A3Q9H7F0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP13A3Q9H7F0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP13A3Q9H7F0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP13A3Q9H7F0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP13A3Q9H7F0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP13A3Q9H7F0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP13A3Q9H7F0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP13A3Q9H7F0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP13A3Q9H7F0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP13A3Q9H7F0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP13A3Q9H7F0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP13A3Q9H7F0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP13A3Q9H7F0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP13A3Q9H7F0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP13A3Q9H7F0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP13A3Q9H7F0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP13A3Q9H7F0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP13A3Q9H7F0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP13A3Q9H7F0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP13A3Q9H7F0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP13A3Q9H7F0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP13A3Q9H7F0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP13A3Q9H7F0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP13A3Q9H7F0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP13A3Q9H7F0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP13A3Q9H7F0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP13A3Q9H7F0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP13A3Q9H7F0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP13A3Q9H7F0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP13A3Q9H7F0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP13A3Q9H7F0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP13A3Q9H7F0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP13A3Q9H7F0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP13A3Q9H7F0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP13A3Q9H7F0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP13A3Q9H7F0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP13A3Q9H7F0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP13A3Q9H7F0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP13A3Q9H7F0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP13A3Q9H7F0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP13A3Q9H7F0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP13A3Q9H7F0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP13A3Q9H7F0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP13A3Q9H7F0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP13A3Q9H7F0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP13A3Q9H7F0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP13A3Q9H7F0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP13A3Q9H7F0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP13A3Q9H7F0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP13A3Q9H7F0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP13A3Q9H7F0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP13A3Q9H7F0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP13A3Q9H7F0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP13A3Q9H7F0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP13A3Q9H7F0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP13A3Q9H7F0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP13A3Q9H7F0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP13A3Q9H7F0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP13A3Q9H7F0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP13A3Q9H7F0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP13A3Q9H7F0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP13A3Q9H7F0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP13A3Q9H7F0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP13A3Q9H7F0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP13A3Q9H7F0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP13A3Q9H7F0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP13A3Q9H7F0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP13A3Q9H7F0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP13A3Q9H7F0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP13A3Q9H7F0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP13A3Q9H7F0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP13A3Q9H7F0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP13A3Q9H7F0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP13A3Q9H7F0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP13A3Q9H7F0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP13A3Q9H7F0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP13A3Q9H7F0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP13A3Q9H7F0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP13A3Q9H7F0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP13A3Q9H7F0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP13A3Q9H7F0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP13A3Q9H7F0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP13A3Q9H7F0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP13A3Q9H7F0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP13A3Q9H7F0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP13A3Q9H7F0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP13A3Q9H7F0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP13A3Q9H7F0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP13A3Q9H7F0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP13A3Q9H7F0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP13A3Q9H7F0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP13A3Q9H7F0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP13A3Q9H7F0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP13A3Q9H7F0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP13A3Q9H7F0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP13A3Q9H7F0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP13A3Q9H7F0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP13A3Q9H7F0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP13A3Q9H7F0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms