Protein–RNA interactions for Protein: Q9H668

STN1, CST complex subunit STN1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STN1Q9H668 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STN1Q9H668 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STN1Q9H668 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
STN1Q9H668 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STN1Q9H668 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STN1Q9H668 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STN1Q9H668 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
STN1Q9H668 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STN1Q9H668 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STN1Q9H668 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
STN1Q9H668 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STN1Q9H668 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STN1Q9H668 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STN1Q9H668 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STN1Q9H668 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STN1Q9H668 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
STN1Q9H668 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STN1Q9H668 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STN1Q9H668 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STN1Q9H668 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STN1Q9H668 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STN1Q9H668 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STN1Q9H668 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STN1Q9H668 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STN1Q9H668 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STN1Q9H668 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STN1Q9H668 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
STN1Q9H668 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
STN1Q9H668 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
STN1Q9H668 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
STN1Q9H668 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STN1Q9H668 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STN1Q9H668 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STN1Q9H668 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STN1Q9H668 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STN1Q9H668 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
STN1Q9H668 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
STN1Q9H668 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
STN1Q9H668 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
STN1Q9H668 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STN1Q9H668 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STN1Q9H668 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STN1Q9H668 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STN1Q9H668 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STN1Q9H668 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
STN1Q9H668 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STN1Q9H668 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STN1Q9H668 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STN1Q9H668 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
STN1Q9H668 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STN1Q9H668 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STN1Q9H668 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
STN1Q9H668 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
STN1Q9H668 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STN1Q9H668 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
STN1Q9H668 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STN1Q9H668 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STN1Q9H668 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STN1Q9H668 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STN1Q9H668 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STN1Q9H668 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STN1Q9H668 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STN1Q9H668 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
STN1Q9H668 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STN1Q9H668 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
STN1Q9H668 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
STN1Q9H668 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STN1Q9H668 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
STN1Q9H668 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
STN1Q9H668 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
STN1Q9H668 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
STN1Q9H668 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
STN1Q9H668 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
STN1Q9H668 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
STN1Q9H668 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
STN1Q9H668 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
STN1Q9H668 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
STN1Q9H668 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
STN1Q9H668 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
STN1Q9H668 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
STN1Q9H668 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
STN1Q9H668 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
STN1Q9H668 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
STN1Q9H668 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STN1Q9H668 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STN1Q9H668 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STN1Q9H668 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STN1Q9H668 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STN1Q9H668 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STN1Q9H668 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STN1Q9H668 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STN1Q9H668 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
STN1Q9H668 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STN1Q9H668 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
STN1Q9H668 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
STN1Q9H668 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STN1Q9H668 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STN1Q9H668 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STN1Q9H668 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STN1Q9H668 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms