Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1D9

POLR3F, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3FQ9H1D9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR3FQ9H1D9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR3FQ9H1D9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR3FQ9H1D9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR3FQ9H1D9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR3FQ9H1D9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR3FQ9H1D9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR3FQ9H1D9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR3FQ9H1D9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR3FQ9H1D9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR3FQ9H1D9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR3FQ9H1D9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR3FQ9H1D9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR3FQ9H1D9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR3FQ9H1D9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR3FQ9H1D9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR3FQ9H1D9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR3FQ9H1D9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR3FQ9H1D9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR3FQ9H1D9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR3FQ9H1D9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR3FQ9H1D9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR3FQ9H1D9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR3FQ9H1D9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR3FQ9H1D9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR3FQ9H1D9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR3FQ9H1D9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR3FQ9H1D9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR3FQ9H1D9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR3FQ9H1D9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR3FQ9H1D9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR3FQ9H1D9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR3FQ9H1D9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR3FQ9H1D9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR3FQ9H1D9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR3FQ9H1D9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR3FQ9H1D9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR3FQ9H1D9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR3FQ9H1D9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR3FQ9H1D9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR3FQ9H1D9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR3FQ9H1D9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR3FQ9H1D9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR3FQ9H1D9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR3FQ9H1D9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR3FQ9H1D9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR3FQ9H1D9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR3FQ9H1D9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR3FQ9H1D9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR3FQ9H1D9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR3FQ9H1D9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR3FQ9H1D9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR3FQ9H1D9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR3FQ9H1D9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR3FQ9H1D9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR3FQ9H1D9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR3FQ9H1D9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR3FQ9H1D9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR3FQ9H1D9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR3FQ9H1D9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR3FQ9H1D9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR3FQ9H1D9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR3FQ9H1D9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR3FQ9H1D9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR3FQ9H1D9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR3FQ9H1D9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR3FQ9H1D9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR3FQ9H1D9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3FQ9H1D9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3FQ9H1D9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3FQ9H1D9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3FQ9H1D9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3FQ9H1D9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3FQ9H1D9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3FQ9H1D9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3FQ9H1D9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3FQ9H1D9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3FQ9H1D9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3FQ9H1D9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3FQ9H1D9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3FQ9H1D9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3FQ9H1D9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3FQ9H1D9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3FQ9H1D9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
POLR3FQ9H1D9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR3FQ9H1D9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR3FQ9H1D9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR3FQ9H1D9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR3FQ9H1D9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR3FQ9H1D9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR3FQ9H1D9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR3FQ9H1D9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR3FQ9H1D9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR3FQ9H1D9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR3FQ9H1D9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR3FQ9H1D9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR3FQ9H1D9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR3FQ9H1D9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR3FQ9H1D9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR3FQ9H1D9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms