Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0K1

SIK2, Serine/threonine-protein kinase SIK2, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK2Q9H0K1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIK2Q9H0K1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIK2Q9H0K1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIK2Q9H0K1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIK2Q9H0K1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIK2Q9H0K1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIK2Q9H0K1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SIK2Q9H0K1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SIK2Q9H0K1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIK2Q9H0K1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIK2Q9H0K1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIK2Q9H0K1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIK2Q9H0K1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIK2Q9H0K1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIK2Q9H0K1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIK2Q9H0K1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIK2Q9H0K1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIK2Q9H0K1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIK2Q9H0K1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIK2Q9H0K1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIK2Q9H0K1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIK2Q9H0K1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIK2Q9H0K1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SIK2Q9H0K1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SIK2Q9H0K1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SIK2Q9H0K1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIK2Q9H0K1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIK2Q9H0K1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIK2Q9H0K1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIK2Q9H0K1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIK2Q9H0K1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIK2Q9H0K1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIK2Q9H0K1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIK2Q9H0K1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SIK2Q9H0K1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIK2Q9H0K1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIK2Q9H0K1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIK2Q9H0K1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIK2Q9H0K1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIK2Q9H0K1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIK2Q9H0K1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIK2Q9H0K1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SIK2Q9H0K1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIK2Q9H0K1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIK2Q9H0K1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIK2Q9H0K1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIK2Q9H0K1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIK2Q9H0K1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SIK2Q9H0K1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIK2Q9H0K1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SIK2Q9H0K1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIK2Q9H0K1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIK2Q9H0K1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIK2Q9H0K1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIK2Q9H0K1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIK2Q9H0K1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIK2Q9H0K1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIK2Q9H0K1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIK2Q9H0K1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIK2Q9H0K1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIK2Q9H0K1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIK2Q9H0K1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIK2Q9H0K1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIK2Q9H0K1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIK2Q9H0K1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SIK2Q9H0K1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIK2Q9H0K1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIK2Q9H0K1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIK2Q9H0K1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIK2Q9H0K1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIK2Q9H0K1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIK2Q9H0K1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIK2Q9H0K1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIK2Q9H0K1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIK2Q9H0K1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIK2Q9H0K1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIK2Q9H0K1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIK2Q9H0K1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIK2Q9H0K1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIK2Q9H0K1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIK2Q9H0K1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SIK2Q9H0K1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIK2Q9H0K1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIK2Q9H0K1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIK2Q9H0K1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SIK2Q9H0K1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIK2Q9H0K1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIK2Q9H0K1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIK2Q9H0K1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIK2Q9H0K1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIK2Q9H0K1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIK2Q9H0K1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIK2Q9H0K1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIK2Q9H0K1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIK2Q9H0K1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIK2Q9H0K1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SIK2Q9H0K1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIK2Q9H0K1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIK2Q9H0K1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIK2Q9H0K1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms