Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC90BQ9GZT6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC90BQ9GZT6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC90BQ9GZT6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC90BQ9GZT6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC90BQ9GZT6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC90BQ9GZT6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC90BQ9GZT6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC90BQ9GZT6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC90BQ9GZT6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC90BQ9GZT6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC90BQ9GZT6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC90BQ9GZT6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC90BQ9GZT6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC90BQ9GZT6 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC90BQ9GZT6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC90BQ9GZT6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC90BQ9GZT6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC90BQ9GZT6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC90BQ9GZT6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC90BQ9GZT6 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC90BQ9GZT6 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC90BQ9GZT6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC90BQ9GZT6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC90BQ9GZT6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC90BQ9GZT6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC90BQ9GZT6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC90BQ9GZT6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC90BQ9GZT6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC90BQ9GZT6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC90BQ9GZT6 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC90BQ9GZT6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC90BQ9GZT6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC90BQ9GZT6 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC90BQ9GZT6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC90BQ9GZT6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC90BQ9GZT6 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC90BQ9GZT6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC90BQ9GZT6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC90BQ9GZT6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC90BQ9GZT6 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC90BQ9GZT6 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC90BQ9GZT6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC90BQ9GZT6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC90BQ9GZT6 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC90BQ9GZT6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC90BQ9GZT6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC90BQ9GZT6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC90BQ9GZT6 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC90BQ9GZT6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC90BQ9GZT6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC90BQ9GZT6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC90BQ9GZT6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC90BQ9GZT6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC90BQ9GZT6 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC90BQ9GZT6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC90BQ9GZT6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC90BQ9GZT6 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC90BQ9GZT6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC90BQ9GZT6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC90BQ9GZT6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC90BQ9GZT6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC90BQ9GZT6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC90BQ9GZT6 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC90BQ9GZT6 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC90BQ9GZT6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC90BQ9GZT6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC90BQ9GZT6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC90BQ9GZT6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC90BQ9GZT6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC90BQ9GZT6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC90BQ9GZT6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC90BQ9GZT6 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC90BQ9GZT6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC90BQ9GZT6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC90BQ9GZT6 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC90BQ9GZT6 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC90BQ9GZT6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC90BQ9GZT6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC90BQ9GZT6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC90BQ9GZT6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC90BQ9GZT6 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC90BQ9GZT6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC90BQ9GZT6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC90BQ9GZT6 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC90BQ9GZT6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC90BQ9GZT6 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC90BQ9GZT6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC90BQ9GZT6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC90BQ9GZT6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC90BQ9GZT6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC90BQ9GZT6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC90BQ9GZT6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC90BQ9GZT6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC90BQ9GZT6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC90BQ9GZT6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC90BQ9GZT6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC90BQ9GZT6 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC90BQ9GZT6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC90BQ9GZT6 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms