Protein–RNA interactions for Protein: Q9C002

NMES1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMES1Q9C002 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NMES1Q9C002 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NMES1Q9C002 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NMES1Q9C002 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NMES1Q9C002 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NMES1Q9C002 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NMES1Q9C002 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NMES1Q9C002 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NMES1Q9C002 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NMES1Q9C002 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NMES1Q9C002 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NMES1Q9C002 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NMES1Q9C002 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NMES1Q9C002 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NMES1Q9C002 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NMES1Q9C002 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NMES1Q9C002 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NMES1Q9C002 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NMES1Q9C002 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NMES1Q9C002 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NMES1Q9C002 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NMES1Q9C002 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NMES1Q9C002 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NMES1Q9C002 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NMES1Q9C002 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NMES1Q9C002 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NMES1Q9C002 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NMES1Q9C002 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NMES1Q9C002 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NMES1Q9C002 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NMES1Q9C002 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NMES1Q9C002 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NMES1Q9C002 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NMES1Q9C002 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NMES1Q9C002 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NMES1Q9C002 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NMES1Q9C002 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NMES1Q9C002 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NMES1Q9C002 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NMES1Q9C002 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NMES1Q9C002 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NMES1Q9C002 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NMES1Q9C002 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NMES1Q9C002 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NMES1Q9C002 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NMES1Q9C002 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NMES1Q9C002 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NMES1Q9C002 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NMES1Q9C002 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NMES1Q9C002 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NMES1Q9C002 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NMES1Q9C002 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NMES1Q9C002 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NMES1Q9C002 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMES1Q9C002 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMES1Q9C002 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMES1Q9C002 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMES1Q9C002 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMES1Q9C002 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMES1Q9C002 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMES1Q9C002 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMES1Q9C002 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMES1Q9C002 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMES1Q9C002 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMES1Q9C002 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMES1Q9C002 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMES1Q9C002 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMES1Q9C002 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMES1Q9C002 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMES1Q9C002 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMES1Q9C002 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMES1Q9C002 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMES1Q9C002 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMES1Q9C002 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMES1Q9C002 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NMES1Q9C002 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NMES1Q9C002 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NMES1Q9C002 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NMES1Q9C002 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NMES1Q9C002 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NMES1Q9C002 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NMES1Q9C002 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NMES1Q9C002 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NMES1Q9C002 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NMES1Q9C002 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NMES1Q9C002 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NMES1Q9C002 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NMES1Q9C002 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NMES1Q9C002 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NMES1Q9C002 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NMES1Q9C002 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NMES1Q9C002 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NMES1Q9C002 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NMES1Q9C002 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NMES1Q9C002 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NMES1Q9C002 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NMES1Q9C002 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NMES1Q9C002 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NMES1Q9C002 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NMES1Q9C002 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms