Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM54Q9BYV2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM54Q9BYV2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM54Q9BYV2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM54Q9BYV2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM54Q9BYV2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM54Q9BYV2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM54Q9BYV2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM54Q9BYV2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM54Q9BYV2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM54Q9BYV2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM54Q9BYV2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM54Q9BYV2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM54Q9BYV2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM54Q9BYV2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM54Q9BYV2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM54Q9BYV2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM54Q9BYV2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM54Q9BYV2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM54Q9BYV2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM54Q9BYV2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM54Q9BYV2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM54Q9BYV2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM54Q9BYV2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM54Q9BYV2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM54Q9BYV2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM54Q9BYV2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM54Q9BYV2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM54Q9BYV2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM54Q9BYV2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM54Q9BYV2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM54Q9BYV2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM54Q9BYV2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM54Q9BYV2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM54Q9BYV2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM54Q9BYV2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM54Q9BYV2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM54Q9BYV2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM54Q9BYV2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM54Q9BYV2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM54Q9BYV2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM54Q9BYV2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM54Q9BYV2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM54Q9BYV2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM54Q9BYV2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM54Q9BYV2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM54Q9BYV2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM54Q9BYV2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM54Q9BYV2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM54Q9BYV2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM54Q9BYV2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM54Q9BYV2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM54Q9BYV2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM54Q9BYV2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM54Q9BYV2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM54Q9BYV2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM54Q9BYV2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM54Q9BYV2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM54Q9BYV2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM54Q9BYV2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM54Q9BYV2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM54Q9BYV2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM54Q9BYV2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM54Q9BYV2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM54Q9BYV2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM54Q9BYV2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM54Q9BYV2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM54Q9BYV2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM54Q9BYV2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM54Q9BYV2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM54Q9BYV2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM54Q9BYV2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM54Q9BYV2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM54Q9BYV2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM54Q9BYV2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms