Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD3

MRPL4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL4Q9BYD3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPL4Q9BYD3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPL4Q9BYD3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPL4Q9BYD3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPL4Q9BYD3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPL4Q9BYD3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPL4Q9BYD3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPL4Q9BYD3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPL4Q9BYD3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPL4Q9BYD3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPL4Q9BYD3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPL4Q9BYD3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPL4Q9BYD3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPL4Q9BYD3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPL4Q9BYD3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPL4Q9BYD3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPL4Q9BYD3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPL4Q9BYD3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
MRPL4Q9BYD3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRPL4Q9BYD3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRPL4Q9BYD3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRPL4Q9BYD3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRPL4Q9BYD3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRPL4Q9BYD3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRPL4Q9BYD3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRPL4Q9BYD3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MRPL4Q9BYD3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MRPL4Q9BYD3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MRPL4Q9BYD3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MRPL4Q9BYD3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MRPL4Q9BYD3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MRPL4Q9BYD3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
MRPL4Q9BYD3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MRPL4Q9BYD3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MRPL4Q9BYD3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
MRPL4Q9BYD3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MRPL4Q9BYD3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MRPL4Q9BYD3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MRPL4Q9BYD3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPL4Q9BYD3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPL4Q9BYD3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPL4Q9BYD3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPL4Q9BYD3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPL4Q9BYD3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPL4Q9BYD3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPL4Q9BYD3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPL4Q9BYD3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPL4Q9BYD3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPL4Q9BYD3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPL4Q9BYD3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPL4Q9BYD3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPL4Q9BYD3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRPL4Q9BYD3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRPL4Q9BYD3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRPL4Q9BYD3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRPL4Q9BYD3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRPL4Q9BYD3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRPL4Q9BYD3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRPL4Q9BYD3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MRPL4Q9BYD3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MRPL4Q9BYD3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRPL4Q9BYD3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRPL4Q9BYD3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRPL4Q9BYD3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRPL4Q9BYD3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRPL4Q9BYD3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRPL4Q9BYD3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRPL4Q9BYD3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
MRPL4Q9BYD3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MRPL4Q9BYD3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MRPL4Q9BYD3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
MRPL4Q9BYD3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MRPL4Q9BYD3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MRPL4Q9BYD3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRPL4Q9BYD3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRPL4Q9BYD3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRPL4Q9BYD3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRPL4Q9BYD3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRPL4Q9BYD3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRPL4Q9BYD3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRPL4Q9BYD3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRPL4Q9BYD3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRPL4Q9BYD3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRPL4Q9BYD3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRPL4Q9BYD3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRPL4Q9BYD3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MRPL4Q9BYD3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MRPL4Q9BYD3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MRPL4Q9BYD3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MRPL4Q9BYD3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MRPL4Q9BYD3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MRPL4Q9BYD3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MRPL4Q9BYD3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MRPL4Q9BYD3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MRPL4Q9BYD3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MRPL4Q9BYD3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MRPL4Q9BYD3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MRPL4Q9BYD3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MRPL4Q9BYD3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MRPL4Q9BYD3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms