Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNG6Q9BXT2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNG6Q9BXT2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNG6Q9BXT2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNG6Q9BXT2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNG6Q9BXT2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNG6Q9BXT2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CACNG6Q9BXT2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CACNG6Q9BXT2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CACNG6Q9BXT2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CACNG6Q9BXT2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
CACNG6Q9BXT2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms