Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXJ4

C1QTNF3, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3Q9BXJ4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1QTNF3Q9BXJ4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1QTNF3Q9BXJ4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1QTNF3Q9BXJ4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1QTNF3Q9BXJ4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1QTNF3Q9BXJ4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1QTNF3Q9BXJ4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1QTNF3Q9BXJ4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1QTNF3Q9BXJ4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1QTNF3Q9BXJ4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1QTNF3Q9BXJ4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1QTNF3Q9BXJ4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1QTNF3Q9BXJ4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1QTNF3Q9BXJ4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1QTNF3Q9BXJ4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1QTNF3Q9BXJ4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1QTNF3Q9BXJ4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1QTNF3Q9BXJ4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1QTNF3Q9BXJ4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1QTNF3Q9BXJ4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1QTNF3Q9BXJ4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1QTNF3Q9BXJ4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1QTNF3Q9BXJ4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1QTNF3Q9BXJ4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1QTNF3Q9BXJ4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1QTNF3Q9BXJ4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1QTNF3Q9BXJ4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1QTNF3Q9BXJ4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1QTNF3Q9BXJ4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1QTNF3Q9BXJ4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1QTNF3Q9BXJ4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1QTNF3Q9BXJ4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1QTNF3Q9BXJ4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1QTNF3Q9BXJ4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1QTNF3Q9BXJ4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1QTNF3Q9BXJ4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1QTNF3Q9BXJ4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1QTNF3Q9BXJ4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1QTNF3Q9BXJ4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1QTNF3Q9BXJ4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C1QTNF3Q9BXJ4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C1QTNF3Q9BXJ4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C1QTNF3Q9BXJ4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C1QTNF3Q9BXJ4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C1QTNF3Q9BXJ4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C1QTNF3Q9BXJ4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C1QTNF3Q9BXJ4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C1QTNF3Q9BXJ4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C1QTNF3Q9BXJ4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
C1QTNF3Q9BXJ4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C1QTNF3Q9BXJ4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C1QTNF3Q9BXJ4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C1QTNF3Q9BXJ4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C1QTNF3Q9BXJ4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C1QTNF3Q9BXJ4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C1QTNF3Q9BXJ4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C1QTNF3Q9BXJ4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C1QTNF3Q9BXJ4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.32■■□□□ 1
C1QTNF3Q9BXJ4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C1QTNF3Q9BXJ4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C1QTNF3Q9BXJ4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C1QTNF3Q9BXJ4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C1QTNF3Q9BXJ4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C1QTNF3Q9BXJ4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C1QTNF3Q9BXJ4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C1QTNF3Q9BXJ4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C1QTNF3Q9BXJ4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.31■■□□□ 1
C1QTNF3Q9BXJ4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.31■■□□□ 1
C1QTNF3Q9BXJ4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.31■■□□□ 1
C1QTNF3Q9BXJ4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.31■■□□□ 1
C1QTNF3Q9BXJ4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C1QTNF3Q9BXJ4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C1QTNF3Q9BXJ4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C1QTNF3Q9BXJ4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C1QTNF3Q9BXJ4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C1QTNF3Q9BXJ4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C1QTNF3Q9BXJ4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.3■■□□□ 1
C1QTNF3Q9BXJ4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C1QTNF3Q9BXJ4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C1QTNF3Q9BXJ4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C1QTNF3Q9BXJ4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C1QTNF3Q9BXJ4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C1QTNF3Q9BXJ4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C1QTNF3Q9BXJ4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C1QTNF3Q9BXJ4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C1QTNF3Q9BXJ4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C1QTNF3Q9BXJ4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C1QTNF3Q9BXJ4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C1QTNF3Q9BXJ4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C1QTNF3Q9BXJ4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C1QTNF3Q9BXJ4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C1QTNF3Q9BXJ4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C1QTNF3Q9BXJ4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C1QTNF3Q9BXJ4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C1QTNF3Q9BXJ4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms