Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG9

PTDSS2, Phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2Q9BVG9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTDSS2Q9BVG9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTDSS2Q9BVG9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTDSS2Q9BVG9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTDSS2Q9BVG9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTDSS2Q9BVG9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTDSS2Q9BVG9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTDSS2Q9BVG9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTDSS2Q9BVG9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTDSS2Q9BVG9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTDSS2Q9BVG9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTDSS2Q9BVG9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTDSS2Q9BVG9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PTDSS2Q9BVG9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PTDSS2Q9BVG9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PTDSS2Q9BVG9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PTDSS2Q9BVG9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTDSS2Q9BVG9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTDSS2Q9BVG9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PTDSS2Q9BVG9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTDSS2Q9BVG9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTDSS2Q9BVG9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTDSS2Q9BVG9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTDSS2Q9BVG9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTDSS2Q9BVG9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTDSS2Q9BVG9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTDSS2Q9BVG9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTDSS2Q9BVG9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTDSS2Q9BVG9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTDSS2Q9BVG9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTDSS2Q9BVG9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTDSS2Q9BVG9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTDSS2Q9BVG9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTDSS2Q9BVG9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTDSS2Q9BVG9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTDSS2Q9BVG9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTDSS2Q9BVG9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTDSS2Q9BVG9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTDSS2Q9BVG9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTDSS2Q9BVG9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTDSS2Q9BVG9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PTDSS2Q9BVG9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTDSS2Q9BVG9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTDSS2Q9BVG9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTDSS2Q9BVG9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTDSS2Q9BVG9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTDSS2Q9BVG9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTDSS2Q9BVG9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PTDSS2Q9BVG9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTDSS2Q9BVG9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTDSS2Q9BVG9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTDSS2Q9BVG9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTDSS2Q9BVG9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PTDSS2Q9BVG9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTDSS2Q9BVG9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTDSS2Q9BVG9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTDSS2Q9BVG9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTDSS2Q9BVG9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTDSS2Q9BVG9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTDSS2Q9BVG9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTDSS2Q9BVG9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTDSS2Q9BVG9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTDSS2Q9BVG9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTDSS2Q9BVG9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTDSS2Q9BVG9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTDSS2Q9BVG9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTDSS2Q9BVG9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTDSS2Q9BVG9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTDSS2Q9BVG9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTDSS2Q9BVG9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTDSS2Q9BVG9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTDSS2Q9BVG9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTDSS2Q9BVG9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTDSS2Q9BVG9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTDSS2Q9BVG9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTDSS2Q9BVG9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTDSS2Q9BVG9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTDSS2Q9BVG9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTDSS2Q9BVG9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTDSS2Q9BVG9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTDSS2Q9BVG9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTDSS2Q9BVG9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTDSS2Q9BVG9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTDSS2Q9BVG9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTDSS2Q9BVG9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PTDSS2Q9BVG9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTDSS2Q9BVG9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTDSS2Q9BVG9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTDSS2Q9BVG9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTDSS2Q9BVG9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTDSS2Q9BVG9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTDSS2Q9BVG9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTDSS2Q9BVG9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTDSS2Q9BVG9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PTDSS2Q9BVG9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTDSS2Q9BVG9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTDSS2Q9BVG9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTDSS2Q9BVG9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTDSS2Q9BVG9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PTDSS2Q9BVG9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms