Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG3

TRIM62, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM62, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM62Q9BVG3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM62Q9BVG3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM62Q9BVG3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM62Q9BVG3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM62Q9BVG3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM62Q9BVG3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM62Q9BVG3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM62Q9BVG3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM62Q9BVG3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM62Q9BVG3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM62Q9BVG3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM62Q9BVG3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM62Q9BVG3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM62Q9BVG3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM62Q9BVG3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM62Q9BVG3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM62Q9BVG3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM62Q9BVG3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM62Q9BVG3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM62Q9BVG3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM62Q9BVG3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM62Q9BVG3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM62Q9BVG3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM62Q9BVG3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM62Q9BVG3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM62Q9BVG3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM62Q9BVG3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM62Q9BVG3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM62Q9BVG3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM62Q9BVG3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM62Q9BVG3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM62Q9BVG3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM62Q9BVG3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM62Q9BVG3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM62Q9BVG3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM62Q9BVG3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM62Q9BVG3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM62Q9BVG3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM62Q9BVG3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM62Q9BVG3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM62Q9BVG3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM62Q9BVG3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM62Q9BVG3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM62Q9BVG3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM62Q9BVG3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM62Q9BVG3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM62Q9BVG3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM62Q9BVG3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM62Q9BVG3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM62Q9BVG3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM62Q9BVG3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM62Q9BVG3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM62Q9BVG3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM62Q9BVG3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM62Q9BVG3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM62Q9BVG3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM62Q9BVG3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM62Q9BVG3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM62Q9BVG3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM62Q9BVG3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM62Q9BVG3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM62Q9BVG3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM62Q9BVG3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM62Q9BVG3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM62Q9BVG3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM62Q9BVG3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM62Q9BVG3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM62Q9BVG3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM62Q9BVG3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM62Q9BVG3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM62Q9BVG3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM62Q9BVG3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM62Q9BVG3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM62Q9BVG3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM62Q9BVG3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM62Q9BVG3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM62Q9BVG3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM62Q9BVG3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM62Q9BVG3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM62Q9BVG3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM62Q9BVG3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM62Q9BVG3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM62Q9BVG3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM62Q9BVG3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM62Q9BVG3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM62Q9BVG3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM62Q9BVG3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM62Q9BVG3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM62Q9BVG3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM62Q9BVG3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM62Q9BVG3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM62Q9BVG3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM62Q9BVG3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM62Q9BVG3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM62Q9BVG3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM62Q9BVG3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM62Q9BVG3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM62Q9BVG3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM62Q9BVG3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM62Q9BVG3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms