Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUK0

CHCHD7, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD7Q9BUK0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms