Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSY4

CHCHD5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD5Q9BSY4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHCHD5Q9BSY4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHCHD5Q9BSY4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHCHD5Q9BSY4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHCHD5Q9BSY4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHCHD5Q9BSY4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHCHD5Q9BSY4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHCHD5Q9BSY4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHCHD5Q9BSY4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHCHD5Q9BSY4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHCHD5Q9BSY4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHCHD5Q9BSY4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHCHD5Q9BSY4 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHCHD5Q9BSY4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHCHD5Q9BSY4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHCHD5Q9BSY4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHCHD5Q9BSY4 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHCHD5Q9BSY4 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHCHD5Q9BSY4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHCHD5Q9BSY4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHCHD5Q9BSY4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHCHD5Q9BSY4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHCHD5Q9BSY4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHCHD5Q9BSY4 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHCHD5Q9BSY4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHCHD5Q9BSY4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHCHD5Q9BSY4 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHCHD5Q9BSY4 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHCHD5Q9BSY4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHCHD5Q9BSY4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHCHD5Q9BSY4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHCHD5Q9BSY4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHCHD5Q9BSY4 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHCHD5Q9BSY4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHCHD5Q9BSY4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHCHD5Q9BSY4 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHCHD5Q9BSY4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHCHD5Q9BSY4 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHCHD5Q9BSY4 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHCHD5Q9BSY4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHCHD5Q9BSY4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHCHD5Q9BSY4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHCHD5Q9BSY4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHCHD5Q9BSY4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHCHD5Q9BSY4 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHCHD5Q9BSY4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHCHD5Q9BSY4 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHCHD5Q9BSY4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHCHD5Q9BSY4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHCHD5Q9BSY4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHCHD5Q9BSY4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHCHD5Q9BSY4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHCHD5Q9BSY4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHCHD5Q9BSY4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHCHD5Q9BSY4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHCHD5Q9BSY4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHCHD5Q9BSY4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHCHD5Q9BSY4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHCHD5Q9BSY4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHCHD5Q9BSY4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHCHD5Q9BSY4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHCHD5Q9BSY4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHCHD5Q9BSY4 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHCHD5Q9BSY4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHCHD5Q9BSY4 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHCHD5Q9BSY4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHCHD5Q9BSY4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHCHD5Q9BSY4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHCHD5Q9BSY4 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHCHD5Q9BSY4 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHCHD5Q9BSY4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHCHD5Q9BSY4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHCHD5Q9BSY4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHCHD5Q9BSY4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHCHD5Q9BSY4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHCHD5Q9BSY4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHCHD5Q9BSY4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHCHD5Q9BSY4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHCHD5Q9BSY4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHCHD5Q9BSY4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHCHD5Q9BSY4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHCHD5Q9BSY4 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHCHD5Q9BSY4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHCHD5Q9BSY4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHCHD5Q9BSY4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHCHD5Q9BSY4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHCHD5Q9BSY4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHCHD5Q9BSY4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHCHD5Q9BSY4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHCHD5Q9BSY4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHCHD5Q9BSY4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHCHD5Q9BSY4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHCHD5Q9BSY4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHCHD5Q9BSY4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHCHD5Q9BSY4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHCHD5Q9BSY4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHCHD5Q9BSY4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CHCHD5Q9BSY4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHCHD5Q9BSY4 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHCHD5Q9BSY4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms