Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRU9

UTP23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP23Q9BRU9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UTP23Q9BRU9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UTP23Q9BRU9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UTP23Q9BRU9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UTP23Q9BRU9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UTP23Q9BRU9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UTP23Q9BRU9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UTP23Q9BRU9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UTP23Q9BRU9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UTP23Q9BRU9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UTP23Q9BRU9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UTP23Q9BRU9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UTP23Q9BRU9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UTP23Q9BRU9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UTP23Q9BRU9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UTP23Q9BRU9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UTP23Q9BRU9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms