Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHOXF2Q9BQY4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHOXF2Q9BQY4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHOXF2Q9BQY4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHOXF2Q9BQY4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHOXF2Q9BQY4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHOXF2Q9BQY4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHOXF2Q9BQY4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHOXF2Q9BQY4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHOXF2Q9BQY4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHOXF2Q9BQY4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHOXF2Q9BQY4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHOXF2Q9BQY4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHOXF2Q9BQY4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHOXF2Q9BQY4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHOXF2Q9BQY4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHOXF2Q9BQY4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHOXF2Q9BQY4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHOXF2Q9BQY4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHOXF2Q9BQY4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHOXF2Q9BQY4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHOXF2Q9BQY4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHOXF2Q9BQY4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHOXF2Q9BQY4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHOXF2Q9BQY4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHOXF2Q9BQY4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHOXF2Q9BQY4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHOXF2Q9BQY4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHOXF2Q9BQY4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHOXF2Q9BQY4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHOXF2Q9BQY4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHOXF2Q9BQY4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RHOXF2Q9BQY4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHOXF2Q9BQY4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHOXF2Q9BQY4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHOXF2Q9BQY4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHOXF2Q9BQY4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHOXF2Q9BQY4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHOXF2Q9BQY4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHOXF2Q9BQY4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHOXF2Q9BQY4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHOXF2Q9BQY4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHOXF2Q9BQY4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RHOXF2Q9BQY4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RHOXF2Q9BQY4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RHOXF2Q9BQY4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RHOXF2Q9BQY4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RHOXF2Q9BQY4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RHOXF2Q9BQY4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RHOXF2Q9BQY4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RHOXF2Q9BQY4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHOXF2Q9BQY4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHOXF2Q9BQY4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHOXF2Q9BQY4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHOXF2Q9BQY4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHOXF2Q9BQY4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHOXF2Q9BQY4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHOXF2Q9BQY4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHOXF2Q9BQY4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHOXF2Q9BQY4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHOXF2Q9BQY4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RHOXF2Q9BQY4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHOXF2Q9BQY4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHOXF2Q9BQY4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHOXF2Q9BQY4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHOXF2Q9BQY4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHOXF2Q9BQY4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RHOXF2Q9BQY4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHOXF2Q9BQY4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHOXF2Q9BQY4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHOXF2Q9BQY4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHOXF2Q9BQY4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHOXF2Q9BQY4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHOXF2Q9BQY4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHOXF2Q9BQY4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHOXF2Q9BQY4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHOXF2Q9BQY4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHOXF2Q9BQY4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHOXF2Q9BQY4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHOXF2Q9BQY4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RHOXF2Q9BQY4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHOXF2Q9BQY4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHOXF2Q9BQY4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHOXF2Q9BQY4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHOXF2Q9BQY4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHOXF2Q9BQY4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHOXF2Q9BQY4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHOXF2Q9BQY4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RHOXF2Q9BQY4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHOXF2Q9BQY4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHOXF2Q9BQY4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHOXF2Q9BQY4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHOXF2Q9BQY4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOXF2Q9BQY4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOXF2Q9BQY4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOXF2Q9BQY4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOXF2Q9BQY4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOXF2Q9BQY4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOXF2Q9BQY4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOXF2Q9BQY4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms