Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE4

SELENOS, Selenoprotein S, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOSQ9BQE4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SELENOSQ9BQE4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SELENOSQ9BQE4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SELENOSQ9BQE4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SELENOSQ9BQE4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SELENOSQ9BQE4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SELENOSQ9BQE4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SELENOSQ9BQE4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SELENOSQ9BQE4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SELENOSQ9BQE4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SELENOSQ9BQE4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SELENOSQ9BQE4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SELENOSQ9BQE4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SELENOSQ9BQE4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SELENOSQ9BQE4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SELENOSQ9BQE4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SELENOSQ9BQE4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SELENOSQ9BQE4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SELENOSQ9BQE4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SELENOSQ9BQE4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SELENOSQ9BQE4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SELENOSQ9BQE4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SELENOSQ9BQE4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SELENOSQ9BQE4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SELENOSQ9BQE4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SELENOSQ9BQE4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SELENOSQ9BQE4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SELENOSQ9BQE4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SELENOSQ9BQE4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SELENOSQ9BQE4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SELENOSQ9BQE4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SELENOSQ9BQE4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SELENOSQ9BQE4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SELENOSQ9BQE4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SELENOSQ9BQE4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SELENOSQ9BQE4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SELENOSQ9BQE4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SELENOSQ9BQE4 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SELENOSQ9BQE4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SELENOSQ9BQE4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SELENOSQ9BQE4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SELENOSQ9BQE4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SELENOSQ9BQE4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SELENOSQ9BQE4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SELENOSQ9BQE4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SELENOSQ9BQE4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SELENOSQ9BQE4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SELENOSQ9BQE4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SELENOSQ9BQE4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SELENOSQ9BQE4 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SELENOSQ9BQE4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SELENOSQ9BQE4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SELENOSQ9BQE4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SELENOSQ9BQE4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SELENOSQ9BQE4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SELENOSQ9BQE4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SELENOSQ9BQE4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SELENOSQ9BQE4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SELENOSQ9BQE4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SELENOSQ9BQE4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SELENOSQ9BQE4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SELENOSQ9BQE4 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SELENOSQ9BQE4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SELENOSQ9BQE4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SELENOSQ9BQE4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SELENOSQ9BQE4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SELENOSQ9BQE4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SELENOSQ9BQE4 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SELENOSQ9BQE4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SELENOSQ9BQE4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SELENOSQ9BQE4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SELENOSQ9BQE4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SELENOSQ9BQE4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SELENOSQ9BQE4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SELENOSQ9BQE4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SELENOSQ9BQE4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SELENOSQ9BQE4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SELENOSQ9BQE4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SELENOSQ9BQE4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SELENOSQ9BQE4 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SELENOSQ9BQE4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SELENOSQ9BQE4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SELENOSQ9BQE4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SELENOSQ9BQE4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SELENOSQ9BQE4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SELENOSQ9BQE4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SELENOSQ9BQE4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SELENOSQ9BQE4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SELENOSQ9BQE4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SELENOSQ9BQE4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SELENOSQ9BQE4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SELENOSQ9BQE4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SELENOSQ9BQE4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SELENOSQ9BQE4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SELENOSQ9BQE4 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SELENOSQ9BQE4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SELENOSQ9BQE4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SELENOSQ9BQE4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SELENOSQ9BQE4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SELENOSQ9BQE4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms