Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
KCNS3Q9BQ31 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNS3Q9BQ31 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNS3Q9BQ31 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNS3Q9BQ31 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNS3Q9BQ31 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNS3Q9BQ31 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNS3Q9BQ31 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNS3Q9BQ31 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNS3Q9BQ31 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNS3Q9BQ31 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNS3Q9BQ31 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNS3Q9BQ31 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNS3Q9BQ31 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNS3Q9BQ31 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNS3Q9BQ31 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNS3Q9BQ31 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNS3Q9BQ31 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20■□□□□ 0.79
KCNS3Q9BQ31 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNS3Q9BQ31 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNS3Q9BQ31 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNS3Q9BQ31 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNS3Q9BQ31 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNS3Q9BQ31 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNS3Q9BQ31 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNS3Q9BQ31 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNS3Q9BQ31 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNS3Q9BQ31 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNS3Q9BQ31 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNS3Q9BQ31 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNS3Q9BQ31 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNS3Q9BQ31 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNS3Q9BQ31 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNS3Q9BQ31 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNS3Q9BQ31 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNS3Q9BQ31 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNS3Q9BQ31 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNS3Q9BQ31 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNS3Q9BQ31 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNS3Q9BQ31 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNS3Q9BQ31 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNS3Q9BQ31 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNS3Q9BQ31 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNS3Q9BQ31 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms