Protein–RNA interactions for Protein: Q99988

GDF15, Growth/differentiation factor 15, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF15Q99988 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GDF15Q99988 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GDF15Q99988 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GDF15Q99988 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GDF15Q99988 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GDF15Q99988 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GDF15Q99988 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GDF15Q99988 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GDF15Q99988 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GDF15Q99988 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GDF15Q99988 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GDF15Q99988 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GDF15Q99988 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GDF15Q99988 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GDF15Q99988 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GDF15Q99988 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GDF15Q99988 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GDF15Q99988 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GDF15Q99988 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GDF15Q99988 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GDF15Q99988 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GDF15Q99988 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GDF15Q99988 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GDF15Q99988 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GDF15Q99988 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GDF15Q99988 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GDF15Q99988 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GDF15Q99988 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GDF15Q99988 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GDF15Q99988 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GDF15Q99988 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GDF15Q99988 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GDF15Q99988 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GDF15Q99988 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GDF15Q99988 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GDF15Q99988 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GDF15Q99988 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GDF15Q99988 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GDF15Q99988 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GDF15Q99988 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GDF15Q99988 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GDF15Q99988 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GDF15Q99988 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GDF15Q99988 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GDF15Q99988 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GDF15Q99988 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GDF15Q99988 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GDF15Q99988 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GDF15Q99988 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GDF15Q99988 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GDF15Q99988 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GDF15Q99988 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GDF15Q99988 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GDF15Q99988 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GDF15Q99988 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GDF15Q99988 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GDF15Q99988 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GDF15Q99988 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GDF15Q99988 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GDF15Q99988 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GDF15Q99988 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GDF15Q99988 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GDF15Q99988 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GDF15Q99988 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GDF15Q99988 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GDF15Q99988 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GDF15Q99988 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GDF15Q99988 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GDF15Q99988 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GDF15Q99988 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GDF15Q99988 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GDF15Q99988 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GDF15Q99988 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GDF15Q99988 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GDF15Q99988 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GDF15Q99988 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GDF15Q99988 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GDF15Q99988 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GDF15Q99988 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GDF15Q99988 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GDF15Q99988 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GDF15Q99988 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GDF15Q99988 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GDF15Q99988 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GDF15Q99988 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GDF15Q99988 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GDF15Q99988 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GDF15Q99988 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GDF15Q99988 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GDF15Q99988 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GDF15Q99988 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GDF15Q99988 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GDF15Q99988 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GDF15Q99988 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GDF15Q99988 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GDF15Q99988 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GDF15Q99988 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GDF15Q99988 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GDF15Q99988 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
GDF15Q99988 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms