Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PITX2Q99697 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PITX2Q99697 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PITX2Q99697 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PITX2Q99697 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PITX2Q99697 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PITX2Q99697 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PITX2Q99697 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PITX2Q99697 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PITX2Q99697 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PITX2Q99697 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PITX2Q99697 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PITX2Q99697 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PITX2Q99697 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PITX2Q99697 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PITX2Q99697 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PITX2Q99697 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PITX2Q99697 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PITX2Q99697 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PITX2Q99697 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PITX2Q99697 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PITX2Q99697 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PITX2Q99697 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PITX2Q99697 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PITX2Q99697 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PITX2Q99697 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PITX2Q99697 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PITX2Q99697 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PITX2Q99697 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PITX2Q99697 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PITX2Q99697 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PITX2Q99697 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PITX2Q99697 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PITX2Q99697 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PITX2Q99697 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PITX2Q99697 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PITX2Q99697 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PITX2Q99697 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PITX2Q99697 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PITX2Q99697 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PITX2Q99697 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PITX2Q99697 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PITX2Q99697 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PITX2Q99697 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PITX2Q99697 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PITX2Q99697 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PITX2Q99697 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PITX2Q99697 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PITX2Q99697 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PITX2Q99697 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PITX2Q99697 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PITX2Q99697 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PITX2Q99697 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PITX2Q99697 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PITX2Q99697 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PITX2Q99697 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PITX2Q99697 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PITX2Q99697 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PITX2Q99697 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PITX2Q99697 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PITX2Q99697 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PITX2Q99697 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PITX2Q99697 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PITX2Q99697 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PITX2Q99697 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PITX2Q99697 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PITX2Q99697 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PITX2Q99697 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PITX2Q99697 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
PITX2Q99697 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
PITX2Q99697 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PITX2Q99697 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PITX2Q99697 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PITX2Q99697 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PITX2Q99697 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PITX2Q99697 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PITX2Q99697 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PITX2Q99697 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PITX2Q99697 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PITX2Q99697 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PITX2Q99697 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PITX2Q99697 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PITX2Q99697 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PITX2Q99697 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PITX2Q99697 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PITX2Q99697 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PITX2Q99697 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PITX2Q99697 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PITX2Q99697 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PITX2Q99697 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PITX2Q99697 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PITX2Q99697 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PITX2Q99697 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PITX2Q99697 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PITX2Q99697 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PITX2Q99697 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PITX2Q99697 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PITX2Q99697 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PITX2Q99697 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PITX2Q99697 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms